Genetske i populacijske značajke potočnog raka Austropotamobius torrentium (Schrank, 1803) u špilji Sušik

master's thesis

• Title (english): Genetic and population characteristics of stone crayfish Austropotamobius torrentium (Schrank, 1803) in Sušik cave
• Author: Karolina Pipinić
• Mentor: Sandra Hudina (mentor)
• Mentor: Matej Vucić (komentor)
• Committee member: Sandra Hudina (predsjednik povjerenstva)
• Committee member: Ivana Maguire (član povjerenstva)
• Committee member: Zoran Marčić (član povjerenstva)
• Committee member: Jasna Lajtner (član povjerenstva)
• Granter: University of Zagreb; Faculty of Science; (Department of Biology); Zagreb
• Defense date and country: 2024-02-22, Croatia
• Scientific / art field, discipline and subdiscipline: NATURAL SCIENCES; Biology

Abstract

Potočni rak, Austropotamobius torrentium (Schrank, 1803), autohtona je i najmanja vrsta slatkovodn ih
deseteronožnih rak ova u Europi i prioritetna vrsta Europske unije. P odručje sjevernih centralnih
Dinarida , uključujući Hrvatsku , prepoznato je kao centar raznolikosti vrste Cilj rada bio je istražiti
genetske i populacijske značajke neistražene populacije ponora Sušik , jednog od rijetkih nalaza ove
vrste u podzemlju . U razdoblju od srpnja do listopada populacija na početnom dijelu ponora je istražena
metodo m označavanja i ponovnog ulova . Svakoj ulovljenoj jedinki određeni su spol, dužina i težina.
Kod ukupno 30 jedinki uzet je jedan pereopod za potrebe genetskih analiza. Tijekom istraživanja,
ulovljena je 181, a označene 153 jedinke. Veličina populacije procijenjena je na 1,01 jedinki / m 2 .
Populacija je stabilna, s ujednačenim omjerom mužjaka i ženki i stabilnom uzrasnom strukturom u kojoj
su zastupljeni svi veličinski razredi. Zabilježena su odstupanja od godišnjeg ciklusa koja potencijalno
pokazuju prilagodbu populacije na špiljski okoliš. Analizom mitohondrijskog gena COI , utvrđena je
pripadnost populacije postojećim haplotipovima 44 i 45, te potencijalno postojanje dva nova haplotipa.
Analiza osam mikrosatelitnih markera pokazala je izoliranost populacije, nepostojanje protoka gena te
vel iku vrijednost privatnih alela što ukazuje na genetsku jedinstvenost populacije . Rezultati rada temelj
su za buduće usporedbe podzemnih i nadzemnih populacija okolice.

Abstract (english)

The stone crayfish, Austropotamobius torrentium (Schrank, 1803), is the smallest native European freshwater crayfish and a priority species on the European union’s Habitats Directive. Northern central Dinarides are recognized as its biodiversity hotspot. The aim of this study was to determine genetic and population characteristics of the stone crayfish in cave Sušik, one of its rare underground populations. Between July and October of 2023, a total of 181 individuals were caught at the mouth of cave Sušik and their sex, length and weight were measured. Of those, 153 were marked to conduct the mark and recapture method. Pereopods were removed from 30 specimens for further genetic analysis. The population is stable, with an estimated size of 1.01 individuals / m2, and with even distribution of sexes and size classes. A deviation from the usual year cycle was noted, possibly indicating an adaptation to subterranean environment. Analysis of mitochondrial COI gene placed the individuals within two existing haplotypes with the possibility of existence of two new ones. Microsatellite analysis established poor gene flow but high number of private alleles, pinpointing isolation of the studied population. The results of this thesis provide baselines for further comparisons of populations above and below ground.

• Keywords: Astacidae; populacijska genetika; populacijska struktura
• Keywords (english): Astacidae; population genetics; population structure
• Language: croatian
• URN:NBN: urn:nbn:hr:217:691367
• Study programme: Title: Experimental Biology-University graduate programme; Study programme type: university; Study level: graduate; Academic / professional title: sveučilišni/a magistar/magistra eksperimentalne biologije (sveučilišni/a magistar/magistra eksperimentalne biologije)
• Type of resource: Text
• File origin: Born digital
• Access conditions: Embargoed access; Embargo expiration date: 2026-02-22
• Created on: 2024-03-08 10:38:39