Pages

Komparativna analiza fosfoproteoma
 sojeva bakterije S. rimosus koji proizvode
 oksitetraciklin
Komparativna analiza fosfoproteoma sojeva bakterije S. rimosus koji proizvode oksitetraciklin
Ela Šarić
Streptomiceti su višestanične bakterije složenog životnog ciklusa. Najpoznatije su po genetičkom potencijalu za sintezu antibiotika širokog spektra u koje spadaju i tetraciklini od izuzetnog komercijalnog značaja. Već desetljećima se bakterija Streptomyces rimosus koristi za proizvodnju oksitetraciklina (OTC) čija godišnja potrošnja prelazi 108 kg. Biosinteza antibiotika je kontrolirana kompleksnim signalnim putevima koji uključuju i fosforilacije proteina. Kako bi...
Kompleksne mreže, mrežni deskriptori i sigurnost u mrežama
Kompleksne mreže, mrežni deskriptori i sigurnost u mrežama
Tanja Vojković
U ovoj disertaciji izložena su istraživanja iz nekoliko područja teorije kompleksnih mreža. Definirane su poopćene verzije mrežnih deskriptora, kao što su transmisija, međupoloženost, vršna produktivnost i vršna profitabilnost koje uzimaju u obzir pretpostavku da u mreži vrhovi na manjim udaljenostima komuniciraju znatno više nego oni na većim udaljenostima. Proučavane su minimalne i maksimalne vrijednosti tih deskriptora i analizirane gornje i donje ograde tih vrijednosti....
Kompleksni spojevi vanadija s derivatima 2-benzotiazolilhidrazona
Kompleksni spojevi vanadija s derivatima 2-benzotiazolilhidrazona
Robert Katava
Reakcijama kondenzacije 2-hidrazinobenzotiazola s različitim aromatskim aldehidima (Ar−CHO) nastaje 2-benzotiazolilhidrazonski ligantni sustav H2L (H2L = Bzt−NH−N=C−Ar; Bzt=benzotiazolil) povećane koordinacijske sposobnosti i pojačane antitumorske aktivnosti. Ligandi su priređini iz aldehida funkcionaliziranih: hidroksilnom skupinom na različitim mjestima u fenilnom fragmentu, hidroksilnom skupinom na naftilnom fragmentu, metoksidinom skupinom na različitim mjestima u naftilnom...
Konformacijska dinamika adenilacijske domene tirocidin-sintetaze 1 praćena metodom fluorescencijske sprektroskopije
Konformacijska dinamika adenilacijske domene tirocidin-sintetaze 1 praćena metodom fluorescencijske sprektroskopije
Matilda Šprung
Neribosomske peptid-sintetaze (NRPS) su veliki multienzimski kompleksi koji nizom transpeptidacijskih reakcija kataliziraju sintezu biološki aktivnih peptidnih produkata. Proces biosinteze započinje na adenilacijskoj (A) domeni koja u prvom koraku katalizira nastanak aminoacil-adenilata, a u drugom prijenos aminokiseline na susjednu tiolacijsku (T) domenu. Kristalne strukture A-domena ukazuju na velike strukturne preinake tijekom katalitičkog ciklusa, a dovode se u vezu s usklađivanjem...
Konstruiranje blokovnih dizajna i jako regularnih grafova s pretpostavljenom grupom automorfizama korištenjem genetskih algoritama
Konstruiranje blokovnih dizajna i jako regularnih grafova s pretpostavljenom grupom automorfizama korištenjem genetskih algoritama
Tin Zrinski
Konstrukcija blokovnih dizajna s određenim dopustivim parametrima se često pokušava izvesti za određeni skup parametara uz pretpostavljanje nekih dodatnih ograničenja na strukturu dizajna kako bi pretraživanje bilo računalno izvedivo. Prirodno ograničenje je pretpostavka da određena grupa automorfizama djeluje na dizajn. Jedna od metoda konstruiranja blokovnih dizajna s pretpostavljenom grupom automorfizama je metoda koja koristi orbitne matrice, a sastoji se od dvaju koraka:...
Konstrukcija ekstremalnih \(\mathbb{Z}_4\)-kodova tipa II
Konstrukcija ekstremalnih \(\mathbb{Z}_4\)-kodova tipa II
Sara Ban
Predmet istraživanja ove doktorske disertacije je konstrukcija ekstremalnih \(\mathbb{Z}_4\)-kodova tipa II, odnosno samodulanih \(\mathbb{Z}_4\)-kodova kod kojih su euklidske težine svih riječi djeljive sa 8 i koji imaju najveću moguću minimalnu euklidsku težinu. Ekstremalne \(\mathbb{Z}_4\)-kodove tipa II konstruiramo iz postojećih ekstremalnih \(\mathbb{Z}_4\)-kodova tipa II i iz binarnih kodova s određenim svojstvima. Cilj je konstrukcija novih ekstremalnih...
Konstrukcija epigenetičkoga CRISPR/Cas9 sustava za ciljanu metilaciju specifičnih CpG mjesta
Konstrukcija epigenetičkoga CRISPR/Cas9 sustava za ciljanu metilaciju specifičnih CpG mjesta
Paula Dobrinić
Metilacija DNA važan je epigenetički mehanizam uključen u regulaciju aktivnosti genoma i normalan razvoj sisavaca. Metilacija CpG mjesta unutar regulatornih regija gena najčešće se povezuje s njihovim utišavanjem, no mehanizmi iza utvrđene korelacije nisu u potpunosti razjašnjeni. Precizne funkcionalne studije ograničene su nedostatkom metoda za ciljanu promjenu metilacijskih oznaka. U tu sam svrhu razvila fleksibilni molekularni alat za ciljanu metilaciju CpG mjesta unutar...
Konstrukcije usmjerenih regularnih grafova iz grupa
Konstrukcije usmjerenih regularnih grafova iz grupa
Matea Zubović
Predmet istraživanja doktorske disertacije su usmjereni regularni grafovi konstruirani iz tranzitivnih permutacijskih grupa. U prvom dijelu disertacije uvest će se osnovni pojmovi i tvrdnje iz teorije grupa, teorije dizajna, teorije grafova i teorije kodiranja. U drugom dijelu disertacije analizirat će se svojstva usmjerenih kvazi-jako regularnih grafova, kao i uvesti i dokazati metode konstrukcije istih iz matrica susjedstva poznatih usmjerenih kvazi-jako regularnih grafova. Takoder,...
Konvergencija blok Jacobijevih metoda
Konvergencija blok Jacobijevih metoda
Erna Begović Kovač
Jacobijeve metode su iterativne metode za računanje spektralne i singularne dekompozicije matrice. Temelje se na transformacijama matrice pomoću dvostranih ravninskih (tzv. Jacobijevih) rotacija koje su birane tako da se izvandijagonalni dio matrice reducira u nekoj mjeri, s ciljem da iterirana matrica postaje sve više dijagonalna. Da bi niz dobivenih matrica konvergirao prema dijagonalnoj matrici, niz izvandijagonalnih normi tih matrica mora konvergirati prema nuli. Teorija perturbacija...
Korelacije u jako-međudjelujućim višečestičnim jednodimenzionalnim sustavima
Korelacije u jako-međudjelujućim višečestičnim jednodimenzionalnim sustavima
Karlo Lelas
U višečestičnim kvantnim sustavima čestice međudjeluju i stvaraju korelacije zbog kojih ne mogu biti opisane nezavisno jedna od druge. Kao posljedica toga valna funkcija sustava je objekt koji sadrži veliku količinu informacija i u većini slučajeva nemoguće ju je egzaktno ili analitički odrediti. Proučavanje korelacija u kontekstu jako međudjelujućih jednodimezionalnih (1D) bozonskih sustava je zanimljivo jer u tom režimu možemo egzaktno odrediti višečestičnu valnu...
Kromosomski rearanžmani u ozračenim mrtvim stanicama bakterije Deinococcus radiodurans: uloga insercijskih sekvenci i proteina RecA
Kromosomski rearanžmani u ozračenim mrtvim stanicama bakterije Deinococcus radiodurans: uloga insercijskih sekvenci i proteina RecA
Svjetlana Cvjetan
U ovom radu istraživani su fundamentalni uzroci stanične smrti u robusnoj bakteriji Deinococcus radiodurans koja preživljava izlaganje ekstremnom isušivanju, ionizirajućem zračenju ili mutagenim kemijskim spojevima. Rezultati ovog istraživanja pokazali su da je ključna „meta“ stanične smrti funkcija (proteom), a ne informacija (genom). Analizirana je sudbina oštećene DNA (dvolančani lomovi i kromosomski rearanžmani u preživjelim i mrtvim stanicama) i oksidacijom oštećenih...
Kvantitativna anliza tramadola i paracetamola u tabletama spektroskopskim i kemometričkim metodama
Kvantitativna anliza tramadola i paracetamola u tabletama spektroskopskim i kemometričkim metodama
Siniša Glavanović
Razvijeni su novi analitički postupci temeljeni na spektroskopskim metodama i kemometričkim izračunima za istovremeno kvantitativno određivanje tramadola i paracetamola u tabletama. Spektroskopski podaci dobiveni analizom tableta primjenom UV-Vis spektrofotometrije, spektroskopije u bliskom infracrvenom području (NIR) te Ramanove spektroskopije obrađeni su upotrebom metode djelomičnih najmanjih kvadrata (PLS), genetičkih algoritama spregnutih s PLS-om (GA-PLS) i umjetnih neuronskih...

Pages