Pages

coRdon: an R package for codon usage analysis and prediction of gene expressivity
coRdon: an R package for codon usage analysis and prediction of gene expressivity
Anamaria Elek
Not all synonymous codons are used with equal frequency in prokaryotic genomes - this selective preference is termed codon usage (CU) bias and is an independent determinant of gene expression regulation at the level of translation. The synonymous codons corresponding to the most abundant cognate tRNA are considered optimal for translation. Codon usage bias can therefore be used to predict the relative expression levels of genes, by comparing CU bias of a specific gene to the CU bias of...
k-sredine i primjene
k-sredine i primjene
Ivana Babić
U ovom radu predstavljene su metode klasteriranja. Opisan je osnovni algoriram k-sredina. Dodatno, algoritmi temeljeni na njemu, koji za cilj imaju prevladavanje problema povezanih s algoritmom k-sredinama, su opisani. Postupak klasteriranja implementiran je u programskom okruzenju Matlab, a testiran je na slučajnoj raspodjeli točaka u prostoru te na slikama u boji i nijansama sive boje.
mRNA cjepiva
mRNA cjepiva
Adriana Lipovčić
Već se desetljećima razvija tehnologija mRNA sintetizirane in vitro transkripcijom, te se proučava njen potencijal u prijenosu genetičke informacije, ekspresiji proteina u organizmu koji su kodirani upravo mRNA transkribiranoj in vitro, izazivanju imunoloških odgovora i imunoterapiji. Posljedično tome mRNA transkribirana in vitro pronašla je svoju potencijalnu primjenu u cjepivima protiv zaraznih bolesti, imunoterapiji za oboljele od karcinoma, terapijama za nadomjestak...
miRNA u molekularnoj dijagnostici
miRNA u molekularnoj dijagnostici
Ana Kujavec
MikroRNA (miRNA) su kratke nekodirajuće molekule RNA koje imaju važnu regulacijsku ulogu u translaciji mRNA. Protekla dva desetljeća privukle su veliku pozornost u biomedicinskim istraživačkim krugovima zbog povezanosti s razvojem brojnih bolesti. Razine ekspresije miRNA su specifične za pojedina tkiva i povezuju se s različitim patološkim stanjima. Omogućuju pružanje informacija o podrijetlu, stupnju diferencijacije i podtipovima malignih tumora te su pronađene u većini...
p-T-uvjeti i geneza tinjčevih škriljavaca s izdanaka Psunjskog metamorfnog kompleksa na Papuku
p-T-uvjeti i geneza tinjčevih škriljavaca s izdanaka Psunjskog metamorfnog kompleksa na Papuku
Tomislav Pilkić
Izdanci psunjskog metamorfnog kompleksa u istoĉnim dijelovima Papuka sadrţe/izgraĊeni su od granat-staurolitnih tinjĉevih škriljavaca. Pojava tih minerala omogućava u povoljnim sluĉajevima rekonstrukciju p-T-metamorfnog puta, a kod nepovoljnih paragenetskih okolnosti odreĊivanje vršnih uvjeta metamorfizma. Primjenom petrografske analize pomoću polarizacijskog mikroskopa, analize mikrostrukturnih odnosa i odreĊivanjem kemijskog sastava minerala i cjelostijenske kemije,...
p-adski brojevi i algebarska proširenja
p-adski brojevi i algebarska proširenja
Tina Šakić
U ovom smo se radu bavili proučavanjem p-adskih brojeva koje je prvi puta opisao njemački matematičar Kurt Hensel 1897. godine. Skup p-adskih brojeva opisali smo u kontekstu teorije skupova, algebre i metričkoga prostora. Prvo smo krenuli od prstena \(\mathbb{Z}p\) p-adskih cijelih brojeva, a budući da smo pokazali da je \(\mathbb{Z}p\) integralna domena, proširili smo \(\mathbb{Z}p\) na polje razlomaka koje smo označavali sa \(\mathbb{Q}p\). Vidjeli smo da je na \(\mathbb{Q}p\)...
p-adski brojevi i p-adska interpolacija Riemannove zeta funkcije
p-adski brojevi i p-adska interpolacija Riemannove zeta funkcije
Vanesa Babok
Ovaj se diplomski rad bavi \(p\)-adskim brojevima i pruža svojevrstan uvod u \(p\)-adsku analizu. Cilj mu je definirati polje p-adskih brojeva \(\mathbb{Q}_p\) te postaviti temelje za usustavljivanje \(p\)-adskog analogona skupa kompleksnih brojeva \(\mathbb{C}\). Rad je podijeljen u tri poglavlja. Prvom poglavlje započinjemo prisjećanjem na pojmove polja, metrike, norme i metričkih prostora. Zatim uvodimo novu vrstu udaljenosti kojom ćemo se baviti kroz ostatak rada - \(p\)-adsku...
q-analogoni kombinatoričkih brojeva i identiteta
q-analogoni kombinatoričkih brojeva i identiteta
Dunja Jagetić
U matematici postoji mnogo istaknutih nizova brojeva, poput parnih i neparnih brojeva, prostih brojeva, kvadrata i kubova brojeva, Fibonaccijevih brojeva itd. U ovom radu proučavamo neke brojeve specifične za područje kombinatorike, i to binomne koeficijente, \(q\)-binomne koeficijente (Gaussove koeficijente), Stirlingove brojeve, \(q\)-Stirlingove brojeve te Bellove brojeve. Binomni koeficijenti \(\binom{n}{k}\) brojevi su koji prebrojavaju \(k\)-člane podskupove konačnog \(n\)-članog...
tRNA-ovisna ugradnja aminokiselina u komponente stanične stijenke i membrana
tRNA-ovisna ugradnja aminokiselina u komponente stanične stijenke i membrana
Patrik Tišma
Mogućnost ugradnje aminokiselina u stanične membrane (pa i stanične stijenke) način je modificiranja lipida i sinteze peptidoglikana, krutog omotača odgovornog za zaštitu i održavanje strukturnog integriteta stanice. U ugradnji i prijenosu aminokiselina ključnu ulogu ima prijenosna RNA (tRNA). Svaka od 20 aminokiselina veže se na vlastitu tRNA, a enzimi koji kataliziraju cijeli proces nazivaju se aminoacil-tRNA-sintetaze (aaRS). Aminoacilacija tRNA je važan korak u...
Čaperon Hsp90 – uloge u smatanju proteina i pokretanju
 noviteta u evoluciji
Čaperon Hsp90 – uloge u smatanju proteina i pokretanju noviteta u evoluciji
Ana Verbanac
Čaperon Hsp90 jedan je od ključnih regulatora proteostaze pod normalnim i stresnim uvjetima za eukariotsku stanicu. Proteini iz obitelji Hsp90 pronađeni su u bakterijama, citosolu, endoplazmatskom retikulumu, mitohondriju i kloroplastu. Svi homolozi imaju slične strukture i funkcije zato što je riječ o vrlo konzerviranoj obitelji proteina. Sa svojim supstratima stvara komplekse te omogućuje konformacijske rearanžmane i poprimanje aktivne strukture proteina supstrata. Uz njih,...
Česi u Hrvatskoj i održivost dvojezičnog obrazovanja
Česi u Hrvatskoj i održivost dvojezičnog obrazovanja
Monika Rohlik
Česi u Hrvatskoj predstavljaju jednu od 22 zakonski priznate nacionalne manjine. Rad donosi povijesni okvir naseljavanja Čeha na hrvatske prostore, kretanje njihovog ukupnog broja, suvremeni prostorni razmještaj, demografska obilježja Čeha u Hrvatskoj, njihov gospodarski značaj te kulturna obilježja manjine. Na temelju statističkih podataka i rezultata provedenog anketnog istraživanja analizirana je održivost dvojezičnog obrazovanja. Faktori koji utječu na održivost dvojezičnog...
Čestina tropskih ciklona u svijetu
Čestina tropskih ciklona u svijetu
Vlade Barun
U radu je prikazana čestina tropskih ciklona u prošlosti kako bi se vidjelo koliko često se oni javljaju. Pokušalo se vidjeti postoje li određene promjene u čestini pod utjecajem klimatskih promjena ili čega drugoga. Prikazano je i javljanje tropskih ciklona u različitim dijelovima svijeta kako bi se vidjelo postoje li veće promjene u samo jednom području. Kasnije u radu je prikazan i utjecaj El Niño južne oscilacije kako bi se vidjeli i neki ostali procesi koji utječu na...

Pages