AlphaFold - novi alat u predviđanju proteinskih struktura

undergraduate thesis

• Author: Antun Habajec
• Mentor: Branimir Bertoša (mentor)
• Granter: University of Zagreb; Faculty of Science; (Department of Chemistry); Zagreb
• Defense date and country: 2022-09-23, Croatia
• Scientific / art field, discipline and subdiscipline: NATURAL SCIENCES; Chemistry

Abstract

AlphaFold je novi program za predviđanje tercijarnih struktura proteina koji daje rezultate koji konkuriraju eksperimentalnim podatcima. Strukture dobivene AlphaFoldom na natjecanjima CASP13 i CASP14 bile su daleko bolje od onih koje su predstavile druge grupe te su pomaknute granice onoga što se smatralo mogućim u kontekstu točnosti predviđenih struktura. Osim toga, napravljena je i baza podataka, AlphaFold DB, u kojoj se nalaze predviđene strukture preko 360 000 proteina. Analizom tih podataka povučene su poveznice s nativno neuređenim proteinima. Budući da je AlphaFold napravljen samo za predviđanje struktura monomernih proteina, napravljen je i poseban program AlphaFold-Multimer koji predviđa strukture proteinskih kompleksa.

• Keywords: AlphaFold; struktura proteina
• Language: croatian
• URN:NBN: urn:nbn:hr:217:869151
• Study programme: Title: Undergraduate university studies in chemistry; Study programme type: university; Study level: undergraduate; Academic / professional title: sveučilišni/a prvostupnik/prvostupnica (baccalaureus/baccalaurea) kemije (sveučilišni/a prvostupnik/prvostupnica (baccalaureus/baccalaurea) kemije)
• Type of resource: Text
• File origin: Born digital
• Access conditions: Open access
• Created on: 2022-10-18 09:56:27