Genska struktura i raznolikost zavičajnih i stranih vrsta pastrva na području Plitvičkih jezera

master's thesis

• Title (english): Genetic structure and diversity of the native and alien species in the Plitvice Lakes area
• Author: Lucija Novoselec
• Mentor: Ivana Buj (mentor)
• Committee member: Ivana Buj (predsjednik povjerenstva)
• Committee member: Zoran Marčić (član povjerenstva)
• Committee member: Ivan Čanjevac (član povjerenstva)
• Committee member: Blanka Cvetko Tešović (član povjerenstva)
• Committee member: Luka Valožić (član povjerenstva)
• Granter: University of Zagreb; Faculty of Science; (Department of Biology); Zagreb
• Defense date and country: 2022-09-19, Croatia
• Scientific / art field, discipline and subdiscipline: NATURAL SCIENCES; Biology

Abstract

Dvije srodne vrste pastrva, Salmo trutta Linnaeus, 1758 i Salmo labrax Pallas, 1814, nastanjuju
područje Plitvičkih jezera. Salmo labrax je zavičajna vrsta na navedenom području gdje je
zabilježena i prisutnost njezinih čistih populacija koje su rijetkost u ostatku Europe. Za razliku
od nje, S. trutta je na promatranom području strana vrsta te negativno utječe na opstanak S.
labrax. Nadalje, prisustvo invazivne vrste Oncorhynchus mykiss (Walbaum, 1792),
eutrofikacija te izgradnja brana i pregrada također ugrožavaju populacije S. labrax kojima
prijeti izumiranje. Cilj ovog istraživanja bio je napraviti filogenetsku rekonstrukciju, odrediti
evolucijsku povijest i osnovne mjere genske raznolikosti te utvrditi protok gena i migracije
između populacija tri navedene vrste kako bi se dobio bolji uvid u njihove odnose. Analize sam
provela na temelju sekvenci gena za citokrom b i kontrolne regije korištenjem metode najveće
parsimonije, metode najveće vjerojatnosti, metode susjednog povezivanja te Bayesove metode.
Dobiveni rezultati potvrđuju da je vrsta S. labrax zavičajna, dok su S. trutta i O. mykiss unesene
iz više različitih izvora na promatrano područje. Utvrđena je vrlo niska genska raznolikost
zavičajne vrste, pogotovo njezinih čistih populacija, kao i zanemarive migracije između njih,
dok više vrijednosti genske raznolikosti zabilježene kod unesenih vrsta upućuju na njihov viši
evolucijski potencijal i bolju prilagodljivost.

Abstract (english)

Two related trout species, Salmo trutta Linnaeus, 1758 and Salmo labrax Pallas, 1814, inhabit
the Plitvice Lakes area. S. labrax is native to the area where its pure populations, considered
rare in the rest of Europe, have been recorded. However, S. trutta is considered an alien species
there and negatively affects the survival of S. labrax. The presence of the invasive
Oncorhynchus mykiss (Walbaum, 1792), eutrophication and the construction of dams and
barriers also pose a threat to S. labrax. The aim of this study was to make a phylogenetic
reconstruction and determine the evolutionary history, basic measures of genetic diversity, gene
flow and migrations of three observed species in order to gain a better insight into their
relationships. I based the analysis on cytochrome b gene and control region sequences using the
methods of maximum parsimony, maximum likelihood, median joining and the Bayesian
analysis. The results confirm S. labrax is native, while S. trutta and O. mykiss were introduced
from several different sources to the observed area. Low genetic diversity of S. labrax,
especially its pure populations, as well as insignificant migration rates between them, were
determined. Higher values of genetic diversity of introduced species indicate their evolutionary
potential.

• Keywords: atlantska pastrva; dunavska pastrva; kalifornijska pastrva; populacijska genetika; konzervacija
• Keywords (english): Danube trout; Atlantic trout; Rainbow trout; population genetics; conservation
• Language: croatian
• URN:NBN: urn:nbn:hr:217:934757
• Study programme: Title: Enviromental Sciences; Study programme type: university; Study level: graduate; Academic / professional title: magistar/magistra struke znanosti o okolišu (magistar/magistra struke znanosti o okolišu)
• Type of resource: Text
• File origin: Born digital
• Access conditions: Open access; Embargo expiration date: 2024-09-19
• Created on: 2022-10-26 11:02:03