Populacijska specifičnost glikozilacije imunoglobulina G

doctoral thesis

• Title (english): Population specificity of immunoglobulin G glycosylation
• Author: Jerko Štambuk
• Mentor: Gordan Lauc (mentor)
• Committee member: Kristian Vlahoviček (član povjerenstva)
• Committee member: Olga Gornik (član povjerenstva)
• Committee member: Alemka Markotić (član povjerenstva)
• Granter: University of Zagreb; Faculty of Science; (Department of Biology); Zagreb
• Defense date and country: 2017, Croatia
• Scientific / art field, discipline and subdiscipline: NATURAL SCIENCES; Biology
• Universal decimal classification (UDC): 57 - Biological sciences. Physical anthropology. Biodiversity

Abstract

Glikozilacija je ključna posttranslacijska modifikacija koja utječe na strukturu i funkciju proteina. Relativno male promjene u glikozilaciji mogu značajno utjecati na proteinsku stabilnost i aktivnost. Imunoglobulin G je najzastupljeniji plazmatski glikoprotein, stoga promjene njegove glikozilacije značajano doprinose promjenama ukupnog N-glikoma. Glikozilacija IgG-a ovisi o spolu i dobi osobe, a povezana je i s različitim fiziološkim i patološkim stanjima. Veliki broj gena i genskih produkata uključen je u kompleksnu regulaciju glikozilacije, koja je još složenija zbog različitih okolišnih utjecaja. U dosadašnjim istraživanjima uočene su razlike u glikozilaciji IgG-a među analiziranim populacijama, no te razlike nikada nisu sustavno analizirane. U ovom doktorskom radu analizirani su glikanski profili ispitanika iz 24 etničke skupine, koji potječu iz 14 zemalja diljem svijeta i utvrđena je međupopulacijska varijabilnost glikozilacije IgG-a. Pokazno je kako 21% varijacije galaktozilacije IgG-a može biti opisano biogeografskim podrijetlom analiziranih uzoraka. Također je pronađena povezanost ljudskog razvojnog indeksa s monogalaktozilacijom IgG1, pa je primjerice, opaženo da je razina galaktozilacije IgG-a veća u razvijenijim zemljama. Time je dokazan jak utjecaj podrijetla ispitanika, odnosno genskih i okolišnih čimbenika, na glikozilaciju IgG-a.

Abstract (english)

Glycosylation is essential posttranslational modification which affects protein structure and function. Relatively small changes in glycosylation can significantly change protein stability and activity. Immunoglobulin G (IgG) is glycoprotein which significantly contributes to Nglycome changes due to its relatively high concentration in plasma. IgG glycosylation is associated with different physiological and pathological states, gender and age. Large number of genes and gene products are involved in complex regulation of glycosylation, which is even more complex because of environmental influence. Many previous studies reported differences in IgG glycosylation between analysed cohorts, but these studies were never conducted on a larger number of samples. In this thesis, IgG Fc glycopeptide profiles of 24 separated populations from 14 different countries were analyzed, in order to determine interpopulational variability of IgG Fc glycosylation in different parts of the world. Results of statistical analysis showed that up to 21% of galactosylation variation can be explained by biogeographical origin of samples. It has been also shown that IgG Fc galactosylation levels are higher in more developed countries. By this manner, a strong influence of subject’s origin, i.e. genetic and environmental factors, on IgG glycosylation has been proven.

• Keywords: glikomika; visokoprotočne metode; N-glikopeptidi; populacijska studija
• Keywords (english): glycomics; high-throughput methods; N-glycopeptides; populational study
• Language: croatian
• URN:NBN: urn:nbn:hr:217:804794
• Study programme: Title: Biology; Study programme type: university; Study level: postgraduate; Academic / professional title: doktor/doktorica znanosti, područje prirodnih znanosti, polje biologija (doktor/doktorica znanosti, područje prirodnih znanosti, polje biologija)
• Type of resource: Text
• File origin: Born digital
• Access conditions: Open access
• Created on: 2017-07-19 09:16:28