Alosteričke promjene konformacije proteina

undergraduate thesis

• Author: Valentina Badurina
• Mentor: Marko Močibob (mentor)
• Granter: University of Zagreb; Faculty of Science; (Department of Chemistry); Zagreb
• Defense date and country: 2017-09-22, Croatia
• Scientific / art field, discipline and subdiscipline: NATURAL SCIENCES; Chemistry

Abstract

Alosterija je jedan od načina regulacije proteinske aktivnosti. Sposobnost alosteričkih proteina da mijenjaju tercijarnu i kvaternu strukturu, što dovodi do razlike u afinitetu vezanja supstrata, uvelike ih razlikuje od uobičajenih proteina. Pomoću alosterije enzimi mogu gotovo trenutno osjetiti koncentraciju metabolita u stanici i djelovati u skladu s time.
U ovom radu opisana su svojstva, građa i konformacijske promjene triju proteina: hemoglobina, te enzima aspartat-transkarbamoilaze i fosfofruktokinaze. Hemoglobin je prvi protein povezan sa specifičnom fiziološkom funkcijom, prijenosom kisika iz područja viših parcijalnih tlakova kisika u područja nižih parcijalnih tlakova kisika. Također je uzet kao predmet proučavanja kojim je potpomognuto objašnjavanje kontrole enzimske aktivnosti i općenitih mehanizama djelovanja alosteričkih proteina. Postoje dva takva osnovna mehanizma: usklađeni i sekvencijalni model alosterije. Usklađeni model podrazumjeva da se svaka podjedinica nalazi u jednom od dva moguća stanja, T i R, dok sekvencijalni model pretpostavlja postojanje više prijelaznih konformacija između dvije krajnosti, T i R stanja.
Alosterički proteini mogu imati više različitih modulatora koji se mogu vezati na različita mjesta na proteinu. Tako je kod hemoglobina vezno mjesto za kisik ujedno i aktivno (katalitičko) i regulatorno (alosteričko) mjesto i nalazi se na sve četiri podjedinice, dok za njegov modulator 2,3-bisfosfoglicerat postoji samo jedno alosteričko mjesto unutar cijelog tetramera. Aspartat-transkarbamoilaza posjeduje dvije vrste podjedinica sa zasebnom ulogom: regulatornu, koja sadrži alosteričko mjesto, i katalitičku, koja sadrži aktivno mjesto dok se kod fosfofruktokinaze 1 aktivno mjesto nalazi uglavnom pri sredini podjedinice, a regulatorno na sučelju podjedinica.

• Keywords: alosterija; proteini
• Language: croatian
• URN:NBN: urn:nbn:hr:217:751703
• Study programme: Title: Undergraduate university studies in chemistry; Study programme type: university; Study level: undergraduate; Academic / professional title: sveučilišni/a prvostupnik/prvostupnica (baccalaureus/baccalaurea) kemije (sveučilišni/a prvostupnik/prvostupnica (baccalaureus/baccalaurea) kemije)
• Type of resource: Text
• File origin: Born digital
• Access conditions: Open access
• Created on: 2017-10-04 12:23:19