Analiza i vizualizacija neuromagnetskih signala

diplomski rad

• Autor: Jela Galić
• Mentor: Lavoslav Čaklović (mentor)
• Član povjerenstva: Lavoslav Čaklović (predsjednik povjerenstva)
• Član povjerenstva: Sanja Josef Golubić (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Goranka Nogo (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Igor Pažanin (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Ivan Kupčić (član povjerenstva)
• Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj: Sveučilište u Zagrebu; Prirodoslovno-matematički fakultet; (Matematički odsjek); Zagreb
• Datum i država obrane: 2019-08-28, Hrvatska
• Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana: PRIRODNE ZNANOSTI; Matematika

Sažetak

Magnetoencefalografija (MEG) je metoda funkcionalnog oslikavanja mozga kojom se mjere vrlo slaba magnetska polja. Takva magnetska polja zahtijevaju upotrebu više stotina superosjetljivih senzora. Obzirom na opsežnost podataka dobivenih MEG mjerenjem, njihova kvalitetna vizualizacija osnovni je preduvjet za daljnje analize. Cilj ovog diplomskog rada je izrada grafičkog korisničkog sučelja za vizualizaciju rezultata magnetoencefalografskih mjerenja. U izradi sučelja koristili smo programsko okruženje R koji je alat otvorenog koda te njegov paket Shiny. Sučelje omogućava učitavanje specifičnih .nc datoteka, prikaz MEG signala snimljenih na senzorskim jedinicama te prikaz usrednjenih MEG signala primjenom funkcije RMS (efektivni signal). Također, pruža mogućnost izbora vrste senzora, prostorne lokacije senzora, broja senzora i vremenskog intervala te direktan prikaz magnitude signala u svakoj točki vektorskog prikaza valne forme. Ovako razvijeno sučelje daje doprinos akademskoj zajednici za analizu rezultata znanstvenih i medicinskih istraživanja MEG-om. Velika prednost korištenja ovog sučelja je mogućnost direktnog očitanja magnitude i latencije signala.

Sažetak (engleski)

Magnetoencephalography is a non-invasive functional brain imaging method for measuring extremely weak magnetic fields. Such neuromagnetic fields require the use of hundreds highly sensitive sensors. According to large amounts of recorded MEG data, good data visualization is the main precondition for further analysis. The aim of this thesis is to create a graphical user interface for visualization of the magnetoencephalographic measurement results. To create the interface, we used the free software environment R and its package Shiny. Created interface allows the user to load specific .nc files, display MEG signals recorded on sensor units and display averaged MEG signals using RMS (effective signal) function. It also provides the selection of different sensor types, sensor spatial locations, number of sensors and time interval. Signal magnitude preview in the waveform vectors at each point is possible as well. Developed interface contributes to the academic community for analyzing the results of scientific and medical research by MEG. The great advantage of using this interface is the ability to read magnitude and latency of the signal directly.

• Ključne riječi: magnetoencefalografija; vizualizacija MEG podataka
• Ključne riječi (engleski): magnetoencephalography; visualization of MEG data
• Jezik: hrvatski
• URN:NBN: urn:nbn:hr:217:262410
• Studijski program: Naziv: Matematika i fizika; smjerovi: nastavnički; Smjer: nastavnički; Vrsta studija: sveučilišni; Stupanj studija: integrirani preddiplomski i diplomski; Akademski / stručni naziv: magistar/magistra edukacije matematike i fizike (mag. educ. math. et phys.)
• Vrsta resursa: Tekst
• Način izrade datoteke: Izvorno digitalna
• Prava pristupa: Otvoreni pristup
• Datum i vrijeme pohrane: 2019-09-30 14:37:15