UNRAVELLING BIOINDICATORS IN FRESHWATERS THROUGH THE INTEGRATION OF eDNA METABARCODING AND MORPHOLOGICAL METHODS

disertacija

• Naslov (engleski): ISTRAŽIVANJE BIOINDIKATORSKIH ORGANIZAMA SLATKIH VODA INTEGRACIJOM eDNA METABARKODIRANJA I MORFOLOŠKIH METODA
• Autor: Antonija Kulaš
• Mentor: Marija Gligora Udovič (mentor)
• Član povjerenstva: Petar Žutinić (predsjednik povjerenstva)
• Član povjerenstva: Sandi Orlić (član povjerenstva)
• Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj: Sveučilište u Zagrebu; Prirodoslovno-matematički fakultet; (Biološki odsjek); Zagreb
• Datum i država obrane: 2023, Hrvatska
• Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana: PRIRODNE ZNANOSTI; Biologija
• Univerzalna decimalna klasifikacija (UDC): 57 - Biološke znanosti. Fizička antropologija. Bioraznolikost

Sažetak

Microbial communities are widely used in biomonitoring assessments as planktic or benthic
organisms, but most attention has been given to one algal group - diatoms, while other
eukaryotic and bacterial groups have been largely overlooked. The objective of this thesis was
to evaluate the reliability of using measurable results of microbial diversity in ecological
researchesin assessing the status of aquatic ecosystems; and to propose potential bioindicators
of microorganisms and water body types that are not currently included in routine monitoring.
Based on the first three publications, it was shown that the comparison of the results obtained
with both approaches allows a comprehensive assessment of the microbial community structure
in the karstic Krka River and in small water body in the alluvial area of the Drava River. The
last publication highlighted the diversity of the overall protist communities in the periphyton,
showing that such information is also crucial for further effective management and protection
of aquatic biodiversity.

Sažetak (engleski)

Mikrobne zajednice koriste se u biomonitoringu kao planktonski ili bentoski organizmi, no
najviše pažnje pridaje se jednoj skupini algi - dijatomejama, dok su drugi eukariotski
mikrorganizmi i bakterije uglavnom zanemarene. Cilj ove doktorske disertacije je bila
usporedba mjerljivosti rezultata dobivenih molekularnim i morfološkim analizama u ekološkim
istraživanjima pri procjeni stanja vodenih ekosustava; te prijedlog potencijalnih
bioindikatorskih skupina mikroorganizama i tipova vodnih tijela koji trenutno nisu uključeni u
rutinski monitoring. Na temelju prve tri publikacije pokazalo se da usporedba rezultata
dobivenih s oba pristupa omogućuje sveobuhvatnu procjenu strukture mikrobne zajednice u
krškoj rijeci Krki i u malim vodnim tijelima u aluvijalnom području rijeke Drave. Posljednja
publikacija istaknula je raznolikost sveobuhvatne zajednice protista u perifitonu, pokazujući da
su takve informacije također ključne za daljnje učinkovito upravljanje i zaštitu slatkovodnih
sustava.

• Ključne riječi: microbial community; morphological approach; eDNA; freshwater assessment
• Ključne riječi (engleski): mikrobna zajednica; morfološki pristup; okolišna DNA (eDNA); ocjena stanja vodenih sustava
• Jezik: engleski
• URN:NBN: urn:nbn:hr:217:937054
• Datum promocije: 2023
• Studijski program: Naziv: Biologija; Vrsta studija: sveučilišni; Stupanj studija: poslijediplomski doktorski; Akademski / stručni naziv: doktor/doktorica znanosti, područje prirodnih znanosti, polje biologija (dr.sc.)
• Vrsta resursa: Tekst
• Način izrade datoteke: Izvorno digitalna
• Prava pristupa: Otvoreni pristup
• Datum i vrijeme pohrane: 2023-03-01 13:13:43