Interakcije bis-benzotiazola supstituiranih amidinom s dvolančanim, trolančanim i hibridnim DNA:RNA polinukleotidima

diplomski rad

• Naslov (engleski): Interactions of amidino-substituted bis-benzothiazoles with double-stranded, triple-stranded and hybrid DNA:RNA polynucleotides
• Autor: Kristina Gunčević
• Mentor: Lidija-Marija Tumir (mentor)
• Član povjerenstva: Morana Dulić (predsjednik povjerenstva)
• Član povjerenstva: Sanda Rončević (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Mirta Rubčić (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Marko Močibob (član povjerenstva)
• Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj: Sveučilište u Zagrebu; Prirodoslovno-matematički fakultet; (Kemijski odsjek); Zagreb
• Datum i država obrane: 2023-02-16, Hrvatska
• Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana: PRIRODNE ZNANOSTI; Kemija

Sažetak

Derivati benzotiazola s amidinskim funkcionalnim skupinama pokazuju značajnu biološku
aktivnost. Četiri novosintetizirana derivata bis-benzotiazola supstituirana amidinom
spektroskopski su okarakterizirana te im je određena temperaturna stabilnost. Ispitane su
interakcije derivata bis-benzotiazola supstituiranih amidinom s DNA, RNA i hibridne
DNA:RNA polinukleotide. Kompeticijskom dijalizom probrani su polinukleotidi prema kojima
spojevi pokazuju najveći afinitet i selektivnost, te su oni korišteni u daljnjem istraživanju.
Eksperimenti temperature mekšanja pokazali su da benzotiazoli stabiliziraju dvolančane,
odnosno trolančane uzvojnice polinukleotida. Dodatak polinukleotida ispitivanim spojevima
uzrokovao je gašenje fluorescencije te su, na temelju fluorescencijskih titracija, izračunate ili
procijenjene konstante asocijacije. Spektri titracija dobiveni metodom cirkularnog dikroizma
ukazuju na mješovite načine vezanja; interkalaciju te vezanje u mali utor i agregiranje spoja
duž fosfatne okosnice. Dobiveni rezultati ukazuju na selektivnost spojeva prema određenim
sekvencama i strukturama nukleinskih kiselina.

Sažetak (engleski)

Amidino-substituted benzothiazole derivates showed significant biological activity. Four newly
synthesized derivates of amidino-substituted bis-benzothiazoles were spectroscopically
characterized and their temperature stability was determined. Interactions of amidinosubstituted bis-benzothiazoles with DNA, RNA and hybrid DNA:RNA polynucleotides were
examined. Interaction of an array of polynucleotides with four benzothiazole derivates was
screened by competition dialysis. According to the screening results (affinities and selectivity)
polynucleotides were selected for detailed characterization. The thermal melting experiment
indicated that benzothiazoles stabilised double-stranded and triple-stranded polynucleotide
helixes. The addition of polynucleotide to the compound solution caused fluorescence
quenching. Association constants were calculated or estimated based on fluorimetric titrations.
Circular dichroism spectroscopy indicated mixed binding modes: intercalation, minor groove
binding and aggregation along the phosphate backbone. The obtained results indicated
benzothiazoles selectivity for specific polynucleotide sequences and structures.

• Ključne riječi: benzotiazol; cirkularni dikroizam; DNA; DNA:RNA hibridi; fluorescencijska titracija; RNA; temperatura mekšanja
• Ključne riječi (engleski): benzothiazole; circular dichroism; DNA; DNA-RNA hybrids; fluorescence titration; RNA; thermal melting
• Jezik: hrvatski
• URN:NBN: urn:nbn:hr:217:824911
• Projekt: Šifra: IP-2018-01-4694; Naziv: Molekularno prepoznavanje DNA:RNA hibridnih i višelančanih struktura u bioanalitičkim i in vitro sustavima; Kratica: DNARNAHyB-MolBio; Voditelj: Marijana Radić Stojković; Pravna nadležnost: Hrvatska; Financijer: HRZZ; Linija financiranja: IP
• Studijski program: Naziv: Kemija; smjerovi: istraživački; Smjer: istraživački; Vrsta studija: sveučilišni; Stupanj studija: diplomski; Akademski / stručni naziv: magistar/magistra kemije (mag. chem.)
• Vrsta resursa: Tekst
• Način izrade datoteke: Izvorno digitalna
• Prava pristupa: Rad dostupan nakon; Datum isteka embarga: 2025-02-16
• Datum i vrijeme pohrane: 2023-03-29 11:25:09