Evolucija i funkcija traspozona MT, specifičnih za glodavce

disertacija

• Naslov (engleski): Evolution and function of rodent specific MT transposons
• Autor: Vedran Franke
• Mentor: Kristian Vlahoviček (mentor)
• Član povjerenstva: Nenad Malenica (predsjednik povjerenstva)
• Član povjerenstva: Helena Ćetković (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Petra Svoboda (član povjerenstva); MBZ: 333151
• Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj: Sveučilište u Zagrebu; Prirodoslovno-matematički fakultet; (Biološki odsjek); Zagreb
• Datum i država obrane: 2016, Hrvatska
• Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana: PRIRODNE ZNANOSTI; Biologija
• Univerzalna decimalna klasifikacija (UDC): 57 - Biološke znanosti. Fizička antropologija. Bioraznolikost

Sažetak

Retrotranspozoni MT pripadaju klasi LTR retrotranspozona, prisutnih isključivo kod glodavaca. Nakon retrotranspozona SINE i LINE, MT elementi su treći najučestaliji ponavljajući elementi u genomima glodavaca. Za razliku od klasičnih LTR retrotranspozona sisavaca, sekvenca između LTR krajeva kod MT elemenata nije homologna retroviralnim GAG, POL i PRO proteinima, već sadržava niz regulatornih sekvenci. One MT elementima omogućavaju tkivno - specifično reprogramiranje transkriptoma a time i doprinos u regulaciji genske ekspresije. MT elementi dijele se u pet skupina, MTA – MTE. MTC element u intronu 6 gena Dicer 1, stvara oocitno specifičnu, skraćenu izoformu proteina – nazvanu DicerO. Takav skraćeni protein pokazuje veću procesivnost malih interferirajućih RNA molekula (siRNA) u usporedbi sa somatskom izoformom proteina, DicerS. Ciljano uklanjanje elementa MTC iz introna 6 gena Dicer 1 ima za posljedicu poremećaje u organizaciji diobenog vretena i sterilnost ženki miševa, iz čega proizlazi da je MTC element esencijalni dio genoma miša. U ovom radu opisao sam podrijetlo, širenje i funkcionalnu ulogu (funkciju) retrotranspozona MT u liniji glodavaca.

Sažetak (engleski)

MT retrotransposons are LTR retrotransposons found specifically in the rodent lineage. After SINE and LINE retrotransposons, MT elements are the third most abundant repetitive class in the rodent genomes. Unlike classical mammalian LTR retrotransposons, the internal sequence of MT elements lacks homology to the retroviral GAG, POL and PRO proteins; rather it contains sets of regulatory sequences. These regulatory sequences enable MT elements to reprogram the transcriptome in an oocyte-specific manner. MT elements are subdivided into five groups, MTA – MTE. An MTC element in the intron 6 of the Dicer 1 gene creates an oocyte specific, truncated Dicer isoform – DicerO. Such truncated isoform has higher processivity for small interfering RNAs, when compared to the somatic isoform, DicerS. Targeted excision of the MTC causes meiotic spindle deformation and female sterility, thereby illustrating its essential function of the retroelement for in mice. In this work I have described the origin and exaptation of MT elements in the rodent lineage.

• Ključne riječi: Retrotranspozon; MT; Oocita; miRNA; siRNA
• Ključne riječi (engleski): Retrotransposon; MT; Oocyte; miRNA; siRNA
• Jezik: hrvatski
• URN:NBN: urn:nbn:hr:217:258467
• Studijski program: Naziv: Biologija; Vrsta studija: sveučilišni; Stupanj studija: poslijediplomski doktorski; Akademski / stručni naziv: doktor/doktorica znanosti, područje prirodnih znanosti, polje biologija (dr.sc.)
• Vrsta resursa: Tekst
• Način izrade datoteke: Izvorno digitalna
• Prava pristupa: Pristup korisnicima matične ustanove
• Datum i vrijeme pohrane: 2017-05-12 10:25:29