Raznolikost gena glavnoga sustava tkivne podudarnosti skupine II u konja prirodno inficiranih patogenim bakterijama iz roda Leptospira

disertacija

• Naslov (engleski): Genetic diversity of major histocompatibility complex class II in horses naturally infected with pathogenic bacteria of the genus Leptospira
• Autor: Vesna Mojčec Perko
• Mentor: Nenad Turk (mentor); MBZ: 205224
• Mentor: Ana Galov (sumentor)
• Član povjerenstva: Jasna Hrenović (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Haidi Arbanasić (član povjerenstva)
• Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj: Sveučilište u Zagrebu; Prirodoslovno-matematički fakultet; (Biološki odsjek); Zagreb
• Datum i država obrane: 2014, Hrvatska
• Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana: PRIRODNE ZNANOSTI; Biologija
• Univerzalna decimalna klasifikacija (UDC): 575 - Opća genetika. Opća citogenetika

Sažetak

Leptospiroza je akutna septikemijska zarazna bolest brojnih vrsta domaćih i divljih životinja, ali i čovjeka, uzrokovana patogenim bakterijama iz roda Leptospira. U konja na području Republike Hrvatske utvrđena je visoka seroprevalencija leptospiroze. Izrazito važnu ulogu u prepoznavanju patogenih mikroorganizama i pokretanju imunosnog odgovora domaćina ima glavni sustav tkivne podudarnosti skupine II (MHC II). U ovom istraživanju analiziran je glavni nositelj genske raznolikosti MHC II regije - egzon 2, DRA i DRB lokusa u 200 konja, 100 inficiranih leptospirama i 100 neinficiranih. Pronađeno je pet DRA i 14 DRB alela, od čega je šest DRB alela utvrđeno po prvi puta. Svaki alel daje jedinstveni aminokiselinski slijed. Utvrđen je 41 DRA/DRB haplotip. Visoka raznolikost alela i postojanje transspecijskog polimorfizma pokazatelji su djelovanja ravnotežne selekcije na lokusima. Statističkim analizama su utvrđene naznake pravila grupiranja jedinki prema haplotipu i serovaru leptospira na koji jedinka pokazuje serološki odgovor, no zbog malog broja jedinki koje pripadaju pojedinoj kategoriji nije moguće pouzdano utvrditi općenita pravila koja bi vrijedila za cjelokupnu populaciju konja.

Sažetak (engleski)

Leptospirosis is a zoonotic disease of worldwide distribution caused by pathogenic bacteria of the genus Leptospira. High seroprevalence of leptospirosis was determined in horse population of Croatia. The major histocompatibility complex class II (MHC II) has a crucial role for patogen presentation to cells of the immune system and initiation of the immune response. The main carrier of genetic variability of MHC II region is exon 2. The genetic diversity and evolutionary history of the exon 2 DRA and DRB loci were analysed in 200 horses, 100 leptospira infected and 100 uninfected. Five DRA and 14 DRB alleles were detected, while six DRB alleles were new. Each allele results in a single amino acid sequence. 41 haplotypes were found. Highly diverged allele sequences and occurrence of trans-species polymorphism provide evidence for action of balancing selection on both loci. The statistical analyzes showed some indications of the rules of grouping individuals according to haplotype and leptospira serovar in which an individual shows serologic response, but due to the small number of individuals in a particular category is not possible to apply certain rules to the entire population of horses.

• Ključne riječi: Equus caballus; leptospiroza; MHC; DRA; DRB
• Ključne riječi (engleski): Equus caballus; leptospirosis; MHC; DRA; DRB
• Jezik: hrvatski
• URN:NBN: urn:nbn:hr:217:828838
• Studijski program: Naziv: Biologija; Vrsta studija: sveučilišni; Stupanj studija: poslijediplomski doktorski; Akademski / stručni naziv: doktor/doktorica znanosti, područje prirodnih znanosti, polje biologija (dr.sc.)
• Vrsta resursa: Tekst
• Način izrade datoteke: Izvorno digitalna
• Prava pristupa: Otvoreni pristup
• Datum i vrijeme pohrane: 2017-05-18 10:25:19