Strukturna analiza N-glikoma krvne plazme dugoživućeg golokrtičastoga štakora (Heterocephalus glaber Rüppell, 1842)

doktorski rad

• Naslov (engleski): Structural analysis of blood plasma N-glycome from a long-lived naked mole-rat (Heterocephalus glaber Rüppell, 1842)
• Autor: Siniša Habazin
• Mentor: Mislav Novokmet (mentor)
• Član povjerenstva: Toma Keser (predsjednik povjerenstva)
• Član povjerenstva: Biljana Balen (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Göran Klobučar (član povjerenstva)
• Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj: Sveučilište u Zagrebu; Prirodoslovno-matematički fakultet; (Biološki odsjek); Zagreb
• Datum i država obrane: 2025-02-24, Hrvatska
• Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana: PRIRODNE ZNANOSTI; Biologija
• Univerzalna decimalna klasifikacija (UDC): 57 - Biološke znanosti. Fizička antropologija. Bioraznolikost

Sažetak

Golokrtičasti štakor (GŠ) (Heterocephalus glaber Rüppell, 1842) je eusocijalni fosorijalni glodavac čiji je prirodni areal Istočna Afrika, a zbog životnog vijeka koji prelazi 30 godina je atraktivan modelni organizam u biologiji starenja. Molekularni mehanizmi otpornosti na kancerogenezu, neurodegeneraciju, hipoksiju i neke vrste boli povezani su sa održavanjem proteostaze u čemu sudjeluju i posttranslacijske modifikacije proteina. Dinamika i raznolikost glikozilacije proteina u GŠ do sada nije... Više istraživana. U ovom je radu pomoću tekućinske kromatografije i spektrometrije masa provedena strukturna analiza N-glikoma krvne plazme GŠ. Određene su strukture i udjeli 160 različitih N-glikana među kojima se ističe strukturni motiv 4-O-acetilacije sijalinskih kiselina. Glikoproteomskom analizom otkriveno je da takvi sijaloglikani potječu s inhibitora proteaza u krvnoj plazmi te je pretpostavljen njihov zaštitni i stabilizirajući utjecaj na proteine. Sakrij dio sažetka

Sažetak (engleski)

The naked mole-rat (NMR) (Heterocephalus glaber Rüppell, 1842) is an eusocial fossorial rodent native to East Africa. Its exceptionally long lifespan of over 30 years makes it a popular non-conventional model organism in the biology of ageing and
longevity. Molecular mechanisms underlying resistance to cancerogenesis, neurodegeneration, hypoxia and certain types of pain are related to the maintenance of proteostasis where key players are protein post-translational modifications. The dynamics... Više and diversity of protein glycosylation in NMR are completely unexplored. In this study, a structural analysis of NMR blood plasma N-glycome was performed using liquid chromatography and mass spectrometry. A total od 160 different N-glycans were annotated and quantified. The core structural motif in the N-glycome of NMR was the presence of 4-O-acetylated sialic acids. Employing a glycoproteomic analysis, 4-Oacetylated sialo-N-glycans were pinpointed to plasma protease inhibitors and their protective and stabilizing effect on the proteins was inferred. Sakrij dio sažetka

• Ključne riječi: glikozilacija; proteomika; spektrometrija masa; ugljikohidrati; starenje
• Ključne riječi (engleski): glycosylation; proteomics; mass spectrometry; carbohydrates; aging
• Jezik: hrvatski
• URN:NBN: urn:nbn:hr:217:564336
• Projekt: Šifra: KK.01.2.2.03.0006; Naziv: Centar kompetencija u molekularnoj dijagnostici; Kratica: CEKOM; Voditelj: Tomislav Krističević; Pravna nadležnost: eu; Financijer: Europska unija; Linija financiranja: European Regional Development Fund
• Studijski program: Naziv: Biologija; Vrsta studija: sveučilišni; Stupanj studija: doktorski studij; Akademski / stručni naziv: doktor/doktorica znanosti u području prirodnih znanosti (dr. sc. natur.)
• Vrsta resursa: Tekst
• Opseg: 173 str., 58 slika, 5 tablica, 236 literaturnih navoda
• Način izrade datoteke: Izvorno digitalna
• Prava pristupa: Otvoreni pristup
• Datum i vrijeme pohrane: 2025-03-03 11:00:38