Biokemijske i epigenetičke promjene u gljive Cryphonectria parasitica (Murr.) Barr zaražene virusom Cryphonectria hypovirus 1

disertacija

• Naslov (engleski): Biochemical and epigenetic changes in Cryphonectria hypovirus 1- infected fungus Cryphonectria parasitica (Murr.) Barr
• Autor: Lucija Nuskern
• Mentor: Mirna Ćurković Perica (mentor)
• Član povjerenstva: Mirta Tkalec (predsjednik povjerenstva)
• Član povjerenstva: Martina Šeruga Musić (član povjerenstva)
• Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj: Sveučilište u Zagrebu; Prirodoslovno-matematički fakultet; Zagreb
• Datum i država obrane: 2017, Hrvatska
• Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana: PRIRODNE ZNANOSTI; Biologija
• Univerzalna decimalna klasifikacija (UDC): 57 - Biološke znanosti. Fizička antropologija. Bioraznolikost

Sažetak

S ciljem određivanja učinka infekcije virusom Cryphonectria hypovirus 1 (CHV1) na intenzitet promjena u metabolizmu gljive Cryphonectria parasitica, u tri virulentna izolata gljive uneseno je šest različitih sojeva virusa talijanskog (I), francuskog (F1) i rekombiniranog talijansko-francuskog (F1/I) podtipa. Infekcija virusom CHV1 dovela je do i) indukcije antioksidacijske obrane u zaraženoj gljivi, odnosno do povećanja aktivnosti antioksidacijskih enzima glutation S-transferaze, katalaze i superoksid dismutaze, ii) do porasta aktivnosti lakaza zaražene gljive, iii) do epigenetičkih promjena, odnosno do porasta metiliranosti CpG sekvenci genoma gljive. Postavljena je hipoteza da je povećana metilacija genoma gljive C. parasitica nakon infekcije virusom čimbenik virulentnosti virusa, a ne dio obrambenog mehanizma gljive. Svi istraživani parametri pokazali su da intenzitet promjena u metabolizmu gljive ovisi o virusnom soju, a ne podtipu virusa, te o genotipu gljive domaćina i kombinaciji genoma gljive i virusa, te je naglašena važnost korištenja više virusnih sojeva i izolata gljive u pokušajima biološke kontrole.

Sažetak (engleski)

Six different strains of Cryphonectria hypovirus 1 (CHV1), of Italian (I), French (F1) and recombinant Italian-French (F1/I) subtype, were transferred into three virulent isolates of fungus Cryphonectria parasitica to determine the effect of virus infection on the fungal metabolism. CHV1 infection: i) induced antioxidative defence in infected fungus – increased activities of antioxidative enzymes glutathione S-transferase, catalase and superoxide dismutase, ii) increased activity of fungal laccases, iii) induced epigenetic changes in the genome of infected fungus – increased methylation levels at CpG sites. Methylation of C. parasitica genome upon CHV1 infection seems to be a virulence determinant of the virus rather than a part of defensive mechanism of the fungus. The severity of observed effects did not depend on virus subtype, but rather on a particular virus strain, fungal genotype, and the combination of the two, stressing the importance of using more virus strains and fungal isolates in the biocontrol efforts.

• Ključne riječi: biotički stres; antioksidacijski enzimi; lakaza; interakcije patogena i domaćina; MSAP epigenotipizacija; rak kore kestena; biološka kontrola
• Ključne riječi (engleski): biotic stress; antioxidative enzymes; laccase; host-pathogen interaction; MSAP epigenotyping; chestnut blight; biocontrol
• Jezik: hrvatski
• URN:NBN: urn:nbn:hr:217:705728
• Studijski program: Naziv: Biologija; Vrsta studija: sveučilišni; Stupanj studija: poslijediplomski doktorski; Akademski / stručni naziv: doktor/doktorica znanosti, područje prirodnih znanosti, polje biologija (dr.sc.)
• Vrsta resursa: Tekst
• Način izrade datoteke: Izvorno digitalna
• Prava pristupa: Otvoreni pristup
• Datum i vrijeme pohrane: 2017-11-02 11:46:43