Iterativno traženje motiva i vreća fraza u genomu i proteomu

diplomski rad

• Naslov (engleski): Iterative search for motifs and phrase bags in the genome and proteome
• Autor: Laura Ramov
• Mentor: Pavle Goldstein (mentor)
• Član povjerenstva: Nela Bosner (predsjednik povjerenstva)
• Član povjerenstva: Franka Miriam Brückler (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Pavle Goldstein (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Marko Erceg (član povjerenstva)
• Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj: Sveučilište u Zagrebu; Prirodoslovno-matematički fakultet; (Matematički odsjek); Zagreb
• Datum i država obrane: 2021-03-04, Hrvatska
• Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana: PRIRODNE ZNANOSTI; Matematika

Sažetak

Napretkom bioinformatike i pronalaskom novih neopisanih proteina javlja se sve veća potreba za novim metodama klasifikacije proteina. U ovom diplomskom radu prezentirali smo dvije metode klasifikacije. Razvili smo i opisali metodu reduciranog alfabeta te proveli all against all metodu. Svaka od tih metoda proizvela je 10-15 motiva za svaku proteinsku familiju pomoću kojih smo klasificirali članove familija.

Sažetak (engleski)

Advances in bioinformatics and the discovery of new protein families increases the need for new protein classification methods. In this thesis we presented two classification methods. We developed and described the reduced alphabet method, and we carried out an all-against-all search. Both methods produced 10-15 motifs for each protein family, which were then used to classify members.

• Ključne riječi: bioinformatika; klasifikacija proteina; metoda reduciranog alfabeta; all against all metoda
• Ključne riječi (engleski): bioinformatics; protein classification; reduced alphabet method; all-against-all search
• Jezik: hrvatski
• URN:NBN: urn:nbn:hr:217:862542
• Studijski program: Naziv: Matematička statistika; Vrsta studija: sveučilišni; Stupanj studija: diplomski; Akademski / stručni naziv: magistar/magistra matematike (mag. math.)
• Vrsta resursa: Tekst
• Način izrade datoteke: Izvorno digitalna
• Prava pristupa: Otvoreni pristup
• Datum i vrijeme pohrane: 2021-03-25 13:16:11