Izolacija i karakterizacija bakteriofaga specifičnih za vrste Acinetobacter baumannii i Escherichia coli iz efluenta zagrebačkog uređaja za pročišćavanje otpadnih voda

diplomski rad

• Naslov (engleski): Isolation and characterization of bacteriophages specific for Acinetobacter baumannii and Escherichia coli species from effluent of the Zagreb wastewater treatment plant
• Autor: Marina Mihaljević
• Mentor: Silvija Černi (mentor)
• Član povjerenstva: Silvija Černi (predsjednik povjerenstva)
• Član povjerenstva: Mladen Krajačić (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Sofia Ana Blažević (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Tomislav Ivanković (član povjerenstva)
• Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj: Sveučilište u Zagrebu; Prirodoslovno-matematički fakultet; (Biološki odsjek); Zagreb
• Datum i država obrane: 2022-02-18, Hrvatska
• Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana: PRIRODNE ZNANOSTI; Biologija

Sažetak

Bakteriofagi (fagi) su virusi koji inficiraju bakterije, te ih posljedično često liziraju. Širenjem
antibiotske rezistencije je porastao interes za terapijsko korištenje faga, osobito kod infekcija
rezistentnim sojevima patogenih bakterija, poput Acinetobacter baumannii. Jedna od osnovnih
metoda proučavanja i izoliranja faga je uzgoj plakova na bakterijskim livadama, a različiti fagi se
često razlikuju po morfologiji plakova koje stvaraju. Cilj ovog istraţivanja bio je izolirati i
karakterizirati fage specifične za bakteriju A. baumannii, te visoko zastupljenu bakteriju
Escherichia coli iz efluenta centralnog ureĎaja za pročišćavanje otpadnih voda grada Zagreba.
Namjera je bila proučiti plakove koje fagi stvaraju na bakterijskim livadama te fage izolirane iz
plakova različite morfologije proučiti transmisijskim elektronskim mikroskopom. Uzorci eluenta
obogaćeni su inkubacijom s navedenim bakterijama pri različitim temperaturama, a prisutnost faga
potvrĎena je konfluentnom lizom bakterijske livade te metodom čistina i plakova tehnikom
nakapavanja. Fagi izolirani iz plakova, uzgojenih metodom čistina u dvostrukom agaru, umnoţeni
su metodom konfluentne lize bakterijske livade te im je odreĎen titar. Na livadama E. coli utvrĎene
su četiri različite morfologije plakova iz kojih su izolirani fagi, dok fagi specifični za A. baumannii
nisu izolirani iz testiranih uzoraka. Korištenom metodom pročišćavanja i koncentriranja uzoraka
nisu dobiveni uzorci zadovoljavajuće kvalitete za karakterizaciju faga elektronskom
mikroskopijom.

Sažetak (engleski)

Bacteriophages (phages) are viruses that infect bacteria, and consequently often lyse host cells.
Interest in the therapeutic usage of phages has increased due to the spread of antibiotic resistance,
especially in infections caused by resistant strains of pathogenic bacteria, such as Acinetobacter
baumannii. One of the fundamental methods for studying and isolating phages is growing plaques
on bacterial lawns, where different phages can often be distinguished by the morphology of plaques
they produce. The aim of this research was to isolate and characterize phages specific for A.
baumannii and highly abundant Escherichia coli from effluent of the Zagreb wastewater treatment
plant; to study phage produced plaques on bacterial lawns; and to observe phages isolated from
plaques of different morphology by transmission electron microscopy. Effluent samples were
enriched by incubation with the mentioned bacteria at different temperatures, and the presence of
phages was confirmed by both confluent lysis of bacterial lawn and combined spot and plaque
assay. Phages, isolated from plaques grown by double agar overlay, were multiplied by confluent
lysis of bacterial lawns and their titer was determined. Four plaques of different morphology were
observed on E. coli bacterial lawns, from which specific phages were isolated, while phages
specific for A. baumannii were not isolated from tested samples. The methodology used for phage
purification and concentration was not of satisfactory quality for their characterization by electron
microscopy.

• Ključne riječi: plak; metoda plakova u dvostrukom agaru; terapija fagima
• Ključne riječi (engleski): plaque; double agar overlay; phage therapy
• Jezik: hrvatski
• URN:NBN: urn:nbn:hr:217:046004
• Studijski program: Naziv: Eksperimentalna biologija; Vrsta studija: sveučilišni; Stupanj studija: diplomski; Akademski / stručni naziv: magistar/magistra eksperimentalne biologije (mag. biol. exp.)
• Vrsta resursa: Tekst
• Način izrade datoteke: Izvorno digitalna
• Prava pristupa: Otvoreni pristup; Datum isteka embarga: 2023-02-18
• Datum i vrijeme pohrane: 2022-03-24 12:59:48