prikaz prve stranice dokumenta Utjecaj abiotičkog stresa na ukupnu genomsku i specifičnu metilaciju rDNA vrsta Quercus robur L. i Lilium bosniacum (Beck) Beck ex Fritsch
Pristup korisnicima matične ustanove
diplomski rad
Utjecaj abiotičkog stresa na ukupnu genomsku i specifičnu metilaciju rDNA vrsta Quercus robur L. i Lilium bosniacum (Beck) Beck ex Fritsch
2011. urn:nbn:hr:217:537359
Bečeheli, Ivona
Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
Biološki odsjek

Citirajte ovaj rad

Bečeheli, I. (2011). Utjecaj abiotičkog stresa na ukupnu genomsku i specifičnu metilaciju rDNA vrsta Quercus robur L. i Lilium bosniacum (Beck) Beck ex Fritsch (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:537359

Bečeheli, Ivona. "Utjecaj abiotičkog stresa na ukupnu genomsku i specifičnu metilaciju rDNA vrsta Quercus robur L. i Lilium bosniacum (Beck) Beck ex Fritsch." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2011. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:537359

Bečeheli, Ivona. "Utjecaj abiotičkog stresa na ukupnu genomsku i specifičnu metilaciju rDNA vrsta Quercus robur L. i Lilium bosniacum (Beck) Beck ex Fritsch." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2011. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:537359

Bečeheli, I. (2011). 'Utjecaj abiotičkog stresa na ukupnu genomsku i specifičnu metilaciju rDNA vrsta Quercus robur L. i Lilium bosniacum (Beck) Beck ex Fritsch', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, citirano: 18.04.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:537359

Bečeheli I. Utjecaj abiotičkog stresa na ukupnu genomsku i specifičnu metilaciju rDNA vrsta Quercus robur L. i Lilium bosniacum (Beck) Beck ex Fritsch [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet; 2011 [pristupljeno 18.04.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:537359

I. Bečeheli, "Utjecaj abiotičkog stresa na ukupnu genomsku i specifičnu metilaciju rDNA vrsta Quercus robur L. i Lilium bosniacum (Beck) Beck ex Fritsch", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb, 2011. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:537359

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:537359
Prijavite se u repozitorij kako biste mogli spremiti objekt u svoju listu.
Podaci o radu
NaslovUtjecaj abiotičkog stresa na ukupnu genomsku i specifičnu metilaciju rDNA vrsta Quercus robur L. i Lilium bosniacum (Beck) Beck ex Fritsch
Naslov (engleski)Effects of a biotic stress on level of global genome and specific rDNA methylation in Quercus robur (L.) and Lilium bosniacum (Beck) Beck ex Fritsch
AutorIvona Bečeheli
MentorVlatka Zoldoš (mentor)
Član povjerenstvaVlatka Zoldoš (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaMirjana Pavlica (član povjerenstva)
Član povjerenstvaGoran Klobučar (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
(Biološki odsjek)
Zagreb
Datum i država obrane2011-05-23, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		PRIRODNE ZNANOSTI
Biologija
Sažetak
Biljke, kao sesilni organizmi koji ne mogu izbjeći stres, razvile su efikasne kratkoročne strategije za adaptaciju na promjene u okolišu koje se najviše odnose na brze promjene u ekspresiji gena putem epigenetičkih mehanizama. U ovom diplomskom radu istraživane su epigenetičke promjene u dvije vrste, hrastu lužnjaku i bosanskom ljiljanu, i to u populacijama trajno izloženim abiotičkom stresu uslijed promjena staništa. Upotrebom metode CRED-RA (Coupled Restriciton Enzyme Digestion-Random Amplification) analizirana je razina ukupne genomske metilacije DNA te metilacije specifičnog rDNA genomskog područja. U genomu bosanskog ljiljana, između stresne i kontrolne populacije, utvrđena je značajna razlika u učestalosti polimorfizama nastalih zbog metilacijskih događaja. Zbog izrazito visoke intra-populacijske genetičke varijabilnosti hrasta lužnjaka, metoda CRED-RA se pokazala nedovoljno preciznom za utvrđivanje metilacijskih događaja na populacijskoj razini. Metodom RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA), utvrđen je veći broj polimorfizama DNA u genomu populacija izloženih stresu obiju istraživanih vrsta. Analiza specifične metilacije rDNA genomskog područja otkrila je hipermetiliranost rDNA sustava hrasta lužnjaka. Usporedbom CRED-RA obrasca specifične metilacije i restrikcijske mape za 18S-26S rRNA podjedinicu ove vrste pronađena su 4 hipometilirana mjesta unutar intergenske razmaknice čija je funkcija regulacija transkripcije ovih gena.
Sažetak (engleski)
Plants, as sessile organisms that can not avoid stress, have developed an effective short-term strategies for adaptation to changes in the environment. These strategies imply rapid changes in gene expression through epigenetic mechanisms. This thesis deals with the study of epigenetic changes in genomes of two species, the common oak and Bosnian lily, growing in habitats continuously exposed to abiotic stress. The level of total genomic DNA methylation and methylation of rDNA region was analysed using method CRED-RA (Coupled Restriction Enzyme Digestion-Random Amplification). CRED-RA revealed statistically significant difference in methylation pattern between the population of Bosnian lily expossed to stres and the control population. Due to extremely high intra-population genetic diversity of the common oak, CRED-RA method proved to be insufficiently precise to determine methylation events on population level. A higher frequency of RAPD polymorphisms was recorded in populations exposed to stress comparing to control populations of both species. Analysis of specific rDNA methylation revealed hypermethylation of coding regions and hypomethylation of intergenic region of oak rDNA. Comparing the CRED-RA pattern and restriction maps for 18S-26S rRNA subunit of this species, 4 hypomethylated loci were found within the intergenic spacer, which implies on the possible role in regulation of rRNA gene transcription.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:217:537359
Studijski programNaziv: Molekularna biologija
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: diplomski
Akademski / stručni naziv: magistar/magistra molekularne biologije (mag. biol. mol.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaPristup korisnicima matične ustanove
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2017-05-02 12:40:50