Tipovi vegetativne kompatibilnosti gljive Cryphonectria parasitica i analiza ORFA regije virusa Cryphonectria hypovirus 1 kontinentalne Hrvatske

diplomski rad

• Naslov (engleski): Vegetative compatibility types of Cryphonectria parasitica and analysis of Cryphonectria hypovirus 1 ORFA region from continental Croatia
• Autor: Ivan Škegro
• Mentor: Marin Ježić (mentor)
• Član povjerenstva: Marin Ježić (predsjednik povjerenstva)
• Član povjerenstva: Goran Klobučar (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Nada Oršolić (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Zoran Tadić (član povjerenstva)
• Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj: Sveučilište u Zagrebu; Prirodoslovno-matematički fakultet; (Biološki odsjek); Zagreb
• Datum i država obrane: 2022-12-19, Hrvatska
• Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana: PRIRODNE ZNANOSTI; Biologija

Sažetak

Gljiva mješinarka Cryphonectria parasitica uzročnik je bolesti raka kore pitomog kestena
(Castanea sativa), a infekcija te gljive virusom Cryphonectria hypovirus 1 (CHV1) joj smanjuje
virulenciju, te tako omogućava prirodnu biološku kontrolu spomenute bolesti. Virus CHV1 je
najbolje proučena vrsta hipovirusa i jedina prisutna u Europi, gdje postoji njegovih pet podtipova.
Horizontalni prijenos virusa CHV1 ograničen je sustavom vegetativne (ne)kompatibilnosti gljive
C. parasitica, tzv. vc-tipom gljive. U tri proučavane populacije kontinentalne Hrvatske utvrđeno
je 12 različitih vc-tipova, među 54 izolata gljive C. parasitica. U populaciji Hrvatske Kostajnice
najzastupljeniji vc-tipovi su EU-1 (22%), te EU-2 i EU-26 (17%), u populaciji Požege to su vctipovi EU-2 (58%) i EU-1 (19%), te konačno u populaciji Slunja to je vc-tip EU-2 (40%). Prisutnost
hipovirusa dokazana je izolacijom ukupne RNA, reverznom transkripcijom, te amplifikacijom
dijela genomske regije ORFA. Prevalencija virusa CHV1 na području Hrvatske Kostajnice iznosi
61%, a u Požegi 23%. Nakon sekvenciranja umnoženih fragmenata potvrđeno je da izolati virusa
CHV1 pripadaju talijanskom podtipu, te su najsrodniji izolatima iz Slovenije, Italije i Švicarske.

Sažetak (engleski)

Sac fungus Cryphonectria parasitica is a causal agent of the chestnut blight, a disease of sweet
chestnut (Castanea sativa). Infection of the fungus with Cryphonectria hypovirus 1 (CHV1)
reduces its virulence, acting as a natural biocontrol agent of the chestnut blight. CHV1 is the best
studied species of hypoviruses and the only one present in Europe, where five subtypes of this virus
have been identified. Its horizontal transmission is limited by a vegetative (in)compatibility (vctype) system of the fungus. Twelve different vc-types were identified among 54 isolates of C.
parasitica from three populations of continental Croatia. The most abundant vc-type in Hrvatska
Kostajnica was EU-1 (22%), followed by EU-2 and EU-26 (17%), in Požega it was EU-2 (58%),
followed by EU-1 (19%). Finally, the most widespread vc-type in Slunj was EU-2 (40%). CHV1
presence was determined by isolation of total RNA, reverse transcription and amplification of a
part of ORFA genomic region. The prevalence of CHV1 is 61% in Hrvatska Kostajnica and 23%
in Požega. After sequencing of the amplified fragments, all virus strains have been confirmed to
belong to the same, Italian subtype, and are closely related to strains from Slovenia, Italy and
Switzerland.

• Ključne riječi: rak kore kestena; RNA virus; molekularna filogenija
• Ključne riječi (engleski): chestnut blight; RNA virus; molecular phylogeny
• Jezik: hrvatski
• URN:NBN: urn:nbn:hr:217:016104
• Studijski program: Naziv: Ekologija i zaštita prirode; Vrsta studija: sveučilišni; Stupanj studija: diplomski; Akademski / stručni naziv: magistar/magistra ekologije i zaštite prirode (mag. oecol. et prot. nat.)
• Vrsta resursa: Tekst
• Način izrade datoteke: Izvorno digitalna
• Prava pristupa: Rad dostupan nakon; Datum isteka embarga: 2024-12-19
• Datum i vrijeme pohrane: 2022-12-20 12:57:11