ULOGA PROTEINA IQGC U REGULACIJI STANIČNE ADHEZIJE U PROTISTU DICTYOSTELIUM DISCOIDEUM

disertacija

• Naslov (engleski): THE ROLE OF IQGC PROTEIN IN THE REGULATION OF ADHESION IN DICTYOSTELIUM DISCOIDEUM PROTIST
• Autor: Lucija Mijanović
• Mentor: Igor Weber (mentor)
• Član povjerenstva: Biljana Balen (predsjednik povjerenstva)
• Član povjerenstva: Inga Urlić (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Vedrana Filić Mileta (član povjerenstva)
• Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj: Sveučilište u Zagrebu; Prirodoslovno-matematički fakultet; (Biološki odsjek); Zagreb
• Datum i država obrane: 2023-03-24, Hrvatska
• Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana: PRIRODNE ZNANOSTI; Biologija
• Univerzalna decimalna klasifikacija (UDC): 577 - Biokemija. Molekularna biologija. Biofizika

Sažetak

Protein IqgC iz protista Dictyostelium discoideum dijeli svojstva proteina iz skupina IQGAP i
RasGAP te regulira endocitozu deaktivacijom male GTPaze RasG. Cilj ovog rada je
karakterizacija dodatne uloge proteina IqgC u regulaciji stanične adhezije. Testovima adhezije
pokazala sam da stanice mutanta iqgCimaju defekt u pričvršćivanju za podlogu. Ekspresijom
skraćenih varijanti proteina IqgC u stanicama iqgCutvrdila sam da je za normalnu adheziju
nužna prisutnost obje domene proteina, domene RGCt i domene GAP. Korištenjem
mikroskopije TIRF ustanovila sam da je protein IqgC lokaliziran u fokalnim adhezijskim
strukturama, gdje ga navodi domena RGCt. Biokemijskim pokusima i metodom BiFC
ustanovila sam da protein IqgC veže malu GTPazu RapA. Analizom kretanja stanica otkrila
sam anomalije u nasumičnom kretanju i kemotaksiji stanica mutanta iqgC-
, vjerojatno
posredovane deregulacijom aktivnosti GTPaza RasG i RapA. Analizom lokalizacije i
aktivnosti proteina IqgC u staničnim sojevima deficijentnim za razne proteine regulatore
adhezije identificirala sam signalni put reguliran proteinom RapA unutar kojeg protein IqgC
djeluje kao pozitivni regulator adhezije.

Sažetak (engleski)

IqgC protein from the protist Dictyostelium discoideum shares the properties of IQGAP and
RasGAP proteins and regulates endocytosis by deactivating small GTPase RasG. The goal of
this work is an investigation of an additional role of IqgC in the regulation of adhesion. Using
adhesion assays, I showed that mutant iqgCcells attach poorly to the substratum. Rescue
experiments with truncated variants of IqgC showed that both RGCt and GAP domains are
necessary for normal adhesion. Using TIRF microscopy, I established that IqgC is localized in
focal adhesion structures and that the RGCt domain is responsible for its proper localization.
Biochemistry and BiFC experiments identified an interaction between IqgC and RapA.
Migration assays detected anomalies in random motility and chemotaxis of iqgCcells, likely
mediated by deregulation of RasG and RapA signaling. By testing the localization and
activity of the IqgC protein in cell strains deficient for various adhesion regulators, I
identified a signaling pathway regulated by RapA where IqgC acts as a positive regulator of
cell adhesion.

• Ključne riječi: adhezija; IqgC; RapA; RasG; GTPaze Ras; Dictyostelium discoideum
• Ključne riječi (engleski): adhesion; IqgC; RapA; RasG; Ras GTPases; Dictyostelium discoideum
• Jezik: hrvatski
• URN:NBN: urn:nbn:hr:217:565685
• Datum promocije: 2023
• Studijski program: Naziv: Biologija; Vrsta studija: sveučilišni; Stupanj studija: poslijediplomski doktorski; Akademski / stručni naziv: doktor/doktorica znanosti, područje prirodnih znanosti, polje biologija (dr.sc.)
• Vrsta resursa: Tekst
• Način izrade datoteke: Izvorno digitalna
• Prava pristupa: Rad dostupan nakon; Datum isteka embarga: 2025-03-24
• Datum i vrijeme pohrane: 2023-04-03 09:25:54