Razvoj metodologije LC-SPE/krio NMR za analizu bioaktivnih molekula i lijekova

disertacija

• Naslov (engleski): Development of a LC-SPE/cryo NMR methodology for analysis of bioactive molecules and drugs
• Autor: Iva Habinovec
• Mentor: Predrag Novak (mentor)
• Član povjerenstva: Ivana Biljan (predsjednik povjerenstva)
• Član povjerenstva: Vlasta Drevenkar (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Dražen Vikić-Topić (član povjerenstva)
• Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj: Sveučilište u Zagrebu; Prirodoslovno-matematički fakultet; (Kemijski odsjek); Zagreb
• Datum i država obrane: 2023-06-06, Hrvatska
• Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana: PRIRODNE ZNANOSTI; Kemija
• Univerzalna decimalna klasifikacija (UDC): 54 - Kemija. Kristalografija. Mineralogija

Sažetak

U ovom su radu istražene mogućnosti primjene metode LC-SPE/krio NMR za praćenje kemijskih reakcija i određivanje strukture sporednih produkata i/ili razgradnih produkata on-line koji nastaju u reakciji, s naglaskom na bioaktivne molekule i lijekove. Za razvoj metodologije odabrana su tri modelna sustava. Za svaki modelni sustav istraženi su uvjeti kromatografskog odjeljivanja komponenata reakcijskih smjesâ, zatim parametri za učinkovitu ekstrakciju odabranih analita na SPE-sorbense te utjecaj parametara ekstrakcije na osjetljivost krio-probe NMR. Za identifikaciju i strukturnu karakterizaciju izoliranih spojeva korištene su spektroskopija NMR i tehnika LC-MS. Prvi modelni sustav bili su karbohidrazidi i njihovi derivati koji imaju kelirajuća svojstva te antioksidativno i antiepileptičko djelovanje. Tijekom analize karbohidrazida istražena je osjetljivost sustava LC-SPE/krio NMR. Drugi modelni sustav bio je etodolak koji pripada skupini nesteroidnih protuupalnih lijekova. Analizom 7-etiltriptofola, polazne tvari u sintezi etodolaka, identificirano je i strukturno okarakterizirano 17 onečišćenja. Treći modelni sustav bili su makrozoni, novi amidni konjugati azitromicina i derivata tiosemikarbazida, koji imaju zadovoljavajuće antibakterijsko djelovanje na odabrane susceptibilne i rezistentne bakterijske sojeve. Analizirano je ukupno 6 reakcijskih smjesâ iz triju različitih klasa novosintetiziranih makrozona. Identificirana onečišćenja bila su sporedni produkti i razgradni produkti makrolidne i tiosemikarbazonske strukture, te dijastereomeri makrozona. Konfiguracije dijastereomerâ predložene su na temelju analize spektara NOESY i računskih simulacija molekulske dinamike. Provedeno istraživanje rezultiralo je razvojem pouzdane, brže i učinkovitije metode za analizu složenih smjesa spojeva koristeći pritom znatno manje količine uzorka i organskih otapala u usporedbi s postojećim metodama off-line. Metoda LC-SPE/krio NMR može imati širu primjenu u ekstrakciji, pročišćavanju i karakterizaciji novosintetiziranih spojeva i/ili onečišćenja iz reakcijskih smjesâ.

Sažetak (engleski)

In this doctoral thesis, the possibilities of applying the LC-SPE/cryo NMR method for monitoring chemical reactions and determining the structure of by-products and/or degradation products on-line, with an emphasis on bioactive molecules and drugs, were explored. Three different model systems were explored for methodology development. For each model system, the parameters for chromatographic separation of the reaction mixtures components, as well as parameters for the efficient extraction of the selected analytes on SPE-sorbents, were optimized. Hence, the influence of the SPE-parameters on the NMR cryoprobe sensitivity was also evaluated. NMR spectroscopy and LC-MS were used for identification and structural characterization of the extracted mixture components. The first model system were carbohydrazides and their derivatives, which are known as chelating reagents and also show antioxidative and antiepileptic effects. Sensitivity of LC-SPE/cryo NMR system was determined by analyzing carbohydrazides. Etodolac, a nonsteroidal anti-inflammatory drug, was chosen as the second model system. During the analysis of 7-ethyltryptophol, a starting material in the synthesis of etodolac, 17 impurities were identified and structurally characterized. The third model system were macrozones, new amide conjugates of azitromycin and thiosemicarbazide derivatives which exhibit good antibacterial activity against susceptible and resistant bacterial strains. Six reaction mixtures from three different classes of newly synthesized macrozones were analysed. Identified impurities were classified as macrolide and non-macrolide related by-products and degradation products, as well as macrozone diastereomers. Configurations of diastereomers were proposed on the basis of NOESY NMR spectroscopy data and molecular dynamic simulations. This research resulted in development of a reliable, faster and more efficient methodology for complex mixture analysis using significantly smaller amount of sample and organic solvents in comparison with standard off-line methods. LC-SPE/cryo NMR method can be applied for the extraction, purification and characterization of newly synthesized compounds and/or impurities from reaction mixtures.

• Ključne riječi: 7-etiltriptofol; etodolak; karbohidrazidi; LC-MS; LC-SPE/krio NMR; makrozoni
• Ključne riječi (engleski): 7-ethyltryptophol; carbohydrazides; etodolac; LC-MS; LC-SPE/cryo NMR; macrozones
• Jezik: hrvatski
• URN:NBN: urn:nbn:hr:217:844152
• Datum promocije: 2023
• Studijski program: Naziv: Kemija; Vrsta studija: sveučilišni; Stupanj studija: poslijediplomski doktorski; Akademski / stručni naziv: doktor/doktorica znanosti, područje prirodnih znanosti, polje kemija (dr. sc.)
• Vrsta resursa: Tekst
• Opseg: 132, LXII str. ; 30 cm
• Način izrade datoteke: Izvorno digitalna
• Prava pristupa: Otvoreni pristup
• Datum i vrijeme pohrane: 2023-07-10 09:24:29