Utjecaj polimorfizama TLR5 (rs2072493) i TLR7 (rs5935436) na transkriptom i metabolom u staničnom modelu karcinoma pluća nemalih stanica

doktorski rad

• Naslov (engleski): Influence of TLR5 (rs2072493) and TLR7 (rs5935436) polymorphisms on transcriptome and metabolome of in vitro model of metastatic non-small cell lung carcinoma
• Autor: Jurica Baranašić
• Mentor: Jelena Knežević (mentor)
• Član povjerenstva: Nada Oršolić (predsjednik povjerenstva)
• Član povjerenstva: Petar Ozretić (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Dragomira Majhen (član povjerenstva)
• Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj: Sveučilište u Zagrebu; Prirodoslovno-matematički fakultet; (Biološki odsjek); Zagreb
• Datum i država obrane: 2023-10-06, Hrvatska
• Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana: PRIRODNE ZNANOSTI; Biologija
• Univerzalna decimalna klasifikacija (UDC): 577 - Biokemija. Molekularna biologija. Biofizika

Sažetak

Karcinom pluća je jedna od najčešćih i najsmrtonosnijih malignih bolesti u svijetu. Uz
izloženost duhanskom dimu, važan čimbenik u nastanku i razvoju navedene bolesti je i genetska
podloga. Aktivacijom receptora Toll-like (TLR) pokreće se složeni signalni put koji u konačnici
kulminira oslobađanjem različitih transkripcijskih čimbenika. Istraživanja koja su prethodila
doktorskoj disertaciji pokazala su povezanost polimorfizma u genima TLR5 (rs2072493) i TLR7
(rs5935436) s nastankom karcinoma pluća. Cilj ovog istraživanja bio je ispitati utjecaj ovih
polimorfizama na transkriptom i metabolom u uvjetima in vitro. Rezultati analize transkriptoma
pokazuju da polimorfizam rs2072493 utječe na promjene u aktivnosti signalnog puta receptora
spregnutim s proteinima G (GPCR). Rezultati analize metaboloma pokazuju da prisutnosti
polimorfizma rs2072493 mijenja aktivnosti metabolizma triptofana. Nadalje, povećanjem
ekspresije gena TLR7, metastatske stanice karcinoma pluća, H1299, postaju osjetljivije na
kotretman imikvimodom i paklitakselom. Također, promjena u ekspresiji TLR7 utječe na
promjene u aktivnosti staničnog puta glikolize, signalnog puta HIF-1, i signalnog puta AMPK.

Sažetak (engleski)

Lung cancer is one of the leading causes of cancer-related deaths worldwide. Exposure to
smoke is the main cause of developing lung cancer, genetic background also has a significant
role. Activation of Toll-like receptors (TLR) starts a complex signaling pathway, which in the
end releases transcriptional factors. Previous associations studies linked polymorphisms in
TLR5 (rs2072493) and TLR7 (rs5935436) with higher susceptibility of developing lung cancer.
The aim of this research was to examine the effect of these polymorphisms on the transcriptome
and metabolome in vitro. The results of the transcriptome analysis show that the rs2072493
polymorphism affects changes in the activity of the G protein-coupled receptor (GPCR)
signaling pathway. The results of the metabolome analysis show that the presence of the
rs2072493 polymorphism changes the activity of tryptophan metabolism. Furthermore,
metastatic lung cancer cells, H1299, overexpressing TLR7 are more sensitive to co-treatment
with imiquimod and paclitaxel. Also, the change in TLR7 expression affects the activity of
glycolysis metabolism, the HIF-1 signaling pathway, and the AMPK signaling pathway.

• Ključne riječi: karcinom pluća; polimorfizmi; TLR5; TLR7; imunosni odgovor
• Ključne riječi (engleski): lung cancer; polymorphisms; TLR5; TLR7; immune response
• Jezik: hrvatski
• URN:NBN: urn:nbn:hr:217:259171
• Datum promocije: 2023
• Studijski program: Naziv: Biologija; Vrsta studija: sveučilišni; Stupanj studija: doktorski studij; Akademski / stručni naziv: doktor/doktorica znanosti u području prirodnih znanosti (dr. sc. natur.)
• Vrsta resursa: Tekst
• Način izrade datoteke: Izvorno digitalna
• Prava pristupa: Otvoreni pristup; Datum isteka embarga: 2024-10-06
• Datum i vrijeme pohrane: 2023-10-25 08:06:53