Raznolikost gena DQA i DQB skupine II glavnog sustava tkivne podudarnosti u čagljeva (Canis aureus)

diplomski rad

• Naslov (engleski): Variability of major histocompatibility complex class II DQA and DQB genes in the golden jackal (Canis aureus)
• Autor: Ida Svetličić
• Mentor: Ana Galov (mentor)
• Član povjerenstva: Ana Galov (predsjednik povjerenstva)
• Član povjerenstva: Božena Mitić (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Ivančica Ternjej (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Mirta Tkalec (član povjerenstva)
• Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj: Sveučilište u Zagrebu; Prirodoslovno-matematički fakultet; (Biološki odsjek); Zagreb
• Datum i država obrane: 2016-02-29, Hrvatska
• Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana: PRIRODNE ZNANOSTI; Biologija

Sažetak

Geni unutar glavnog sustava tkivne podudarnosti (MHC) kodiraju receptore koji su odgovorni za preradu i prikazivanje antigena limfocitima T, čime se pokreće adaptivni imunosni odgovor organizma. Veća varijabilnost genskih lokusa MHC omogućuje prepoznavanje šireg spektra antigena, pa posljedično i bolju obranu od patogena. Varijabilnost lokusa MHC održava ravnotežna selekcija, koju karakterizira veći broj raznolikih alela u populaciji. Geni MHC pokazali su se kao dobar marker za proučavanje adaptivne evolucije vrsta i populacija. Čagalj (Canis aureus) široko je rasprostranjen ali jedan od dosad najmanje istraženih pripadnika porodice pasa (Canidae). U ovom istraživanju utvrdila sam i opisala alele na lokusima DLA-DQA i DQB gena MHC skupine II u uzorku od 27 čagljeva iz istočne Europe. Pronašla sam 2 alela po lokusu, a svi su poznati iz prethodnih istraživanja. Unatoč malom broju pronađenih alela, evolucijske udaljenosti ukazuju na veliku raznolikost među njima. Potvrdila sam djelovanje ravnotežne selekcije na održavanje varijabilnosti oba istražena lokusa koristeći omjer stopa nesinonimnih i sinonimnih mutacija na čitavom nukleotidnom slijedu, kao i na pojedinim kodonima.

Sažetak (engleski)

Genes within the major histocompatibility complex (MHC) encode receptors that are responsible for processing and presentation of antigens to T lymphocytes, which initiates the adaptive immune response of the organism. Increased variability of MHC gene loci enables identification of a broader range of antigens, and consequently a better defense against pathogens. The variability of the MHC loci is maintained by the balancing selection, which is characterized by a larger number of divergent alleles in the population. MHC genes proved to be a good marker for the study of adaptive evolution of the species and populations. Golden jackal (Canis aureus) is widespread, but so far one of the least studied members of the dog family (Canidae). In this research, I found and described the alleles of the DLA-DQA and DQB MHC class II loci in a sample of 27 jackals from Eastern Europe. I found two alleles per locus, all of which are known from previous research. Despite the small number of alleles found, evolutionary distances indicate a considerable diversity among them. I confirmed the role of balancing selection on maintaining variability of the investigated loci, using the ratio of synonymous and nonsynonymous mutations both on the entire nucleotide sequence, and the particular codons.

• Ključne riječi: MHC; Canis aureus; DQA; DQB; ravnotežna selekcija
• Ključne riječi (engleski): MHC; Canis aureus; DRQB; DQA; balancing selection
• Jezik: hrvatski
• URN:NBN: urn:nbn:hr:217:187581
• Studijski program: Naziv: Eksperimentalna biologija; Vrsta studija: sveučilišni; Stupanj studija: diplomski; Akademski / stručni naziv: magistar/magistra eksperimentalne biologije (mag. biol. exp.)
• Vrsta resursa: Tekst
• Način izrade datoteke: Izvorno digitalna
• Prava pristupa: Otvoreni pristup
• Datum i vrijeme pohrane: 2017-05-12 08:46:20