Uloga proteina IqgC u regulaciji makropinocitoze u amebi Dictyostelium discoideum

doktorski rad

• Naslov (engleski): The role of IqgC protein in the regulation of macropinocytosis in amoeba Dictyostelium discoideum
• Autor: Darija Putar Brajković
• Mentor: Vedrana Filić Mileta (mentor)
• Član povjerenstva: Maja Herak-Bosnar (predsjednik povjerenstva)
• Član povjerenstva: Igor Weber (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Biljana Balen (član povjerenstva)
• Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj: Sveučilište u Zagrebu; Prirodoslovno-matematički fakultet; Zagreb
• Datum i država obrane: 2024-02-21, Hrvatska
• Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana: PRIRODNE ZNANOSTI; Biologija
• Univerzalna decimalna klasifikacija (UDC): 577 - Biokemija. Molekularna biologija. Biofizika

Sažetak

Protein IqgC iz protista D. discoideum djeluje kao GAP (GTPase activating protein) prema GTPazi RasG, čime je deaktivira i tako suprimira makropinocitozu. Međutim, kako je makropinocitoza u akseničnim sojevima ovog organizma konstitutivno pojačana, delecija gena iqgC u akseničnom soju rezultirala je neznatnim pojačanjem makropinocitoze. U ovom radu pokazala sam da delecija gena iqgC ima znatno veću pozitivnu ulogu u regulaciji makropinocitoze u soju divljeg tipa čija makropinocitoza je uvelike suprimirana. Nadalje, ustanovila sam da je RasG neophodan za vezanje IqgC na membranu makropinosoma, dok interakcija IqgC s fosfoinozitidima doprinosi stabilizaciji vezanja. Pokazala sam također da IqgC izravno interagira s GTPazom Rab5A, ali ne utječe na njenu GTPaznu aktivnost, dok suvišak Rab5A inhibira GAP aktivnost IqgC prema RasG in vitro. Također, prekomjerna ekspresija Rab5A izaziva preuranjenu disocijaciju IqgC s makropinosoma. Dobiveni rezultati pokazuju da, osim interakcije proteina IqgC i RasG, interakcija IqgC i Rab5A također igra ulogu u regulaciji makropinocitoze.

Sažetak (engleski)

The D. discoideum protein IqgC is a RasG-specific GAP (GTPase activating protein) that negatively regulates macropinocytosis. However, deletion of iqgC in the axenic strain induced only a minor enhancement of macropinocytosis, as axenic cells already exhibit upregulated fluid uptake. Therefore, in this work, I deleted iqgC in the wild-type strain, whose macropinocytosis is largely suppressed, and demonstrated a more pronounced positive effect on fluid uptake upon IqgC depletion. Furthermore, I demonstrated that RasG is essential for IqgC recruitment to macropinosomes, while IqgC binding to phosphoinositides likely contributes to stabilization of the association. I showed that IqgC also interacts with GTPase Rab5A but does not affect its activity. Actually, an excessive amount of Rab5A inhibits the GAP activity of IqgC towards RasG in vitro and induces premature dissociation of IqgC from the macropinosome in vivo. These results suggest that interactions between IqgC and both GTPases play a regulatory role in macropinocytosis.

• Ključne riječi: IqgC; RasG; Rab5; RasGAP; makropinocitoza; Dictyostelium
• Ključne riječi (engleski): IqgC; RasG; Rab5; RasGAP; macropinocytosis; Dictyostelium
• Jezik: hrvatski
• URN:NBN: urn:nbn:hr:217:491160
• Datum promocije: 2024
• Projekt: Šifra: IP-2020-02-1572; Naziv: Regulacija endocitoze na velikoj skali pomoću IQGAP proteinima srodnih proteina IqgC i IqgD; Kratica: RegEndIqCD; Voditelj: Vedrana Filić Mileta; Pravna nadležnost: Hrvatska; Financijer: HRZZ; Linija financiranja: IP
• Projekt: Šifra: 180584; Naziv: Phagocytosis and Macropinocytosis, a mechanistic view; Voditelj: Igor Weber; Pravna nadležnost: Hrvatska; Financijer: HRZZ; Linija financiranja: HSIP
• Studijski program: Naziv: Biologija; Vrsta studija: sveučilišni; Stupanj studija: doktorski studij; Akademski / stručni naziv: doktor/doktorica znanosti u području prirodnih znanosti (dr. sc. natur.)
• Vrsta resursa: Tekst
• Način izrade datoteke: Izvorno digitalna
• Prava pristupa: Otvoreni pristup
• Datum i vrijeme pohrane: 2024-02-27 10:34:53