Pristupi za funcionalizaciju proteina i proširenje enzimske katalize

završni rad

• Autor: Antonio Močinić
• Mentor: Aleksandra Maršavelski (mentor)
• Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj: Sveučilište u Zagrebu; Prirodoslovno-matematički fakultet; (Kemijski odsjek); Zagreb
• Datum i država obrane: 2024-07-12, Hrvatska
• Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana: PRIRODNE ZNANOSTI; Kemija

Sažetak

Budući da su proteini u svom nativnom obliku odgovorni za čitav niz složenih funkcija koje je jako teško ostvariti u ne-biološkom okruženju, funkcionalizacija proteina pokazala se kao izvrstan pristup u rješavanju mnogih problema suvremenog društva. Modifikacijom postojećih proteina ili modeliranjem novih mogu se riješiti problemi koje bi inače bilo iznimno teško riješiti klasičnim kemijskim putem. Uz pomoć softvera za energetsku optimizaciju, iz strukturnog proteina FraC, dobivena je nanopora za razgradnju čestica mikroplastike, koja ima veliki potencijal u rješavanju globalnog problema zagađenja plastikom. Sličnim je pristupom poboljšana i katalitička aktivnost jedne serinske esterske hidrolaze, te joj je dodano i dodatno aktivno mjesto, tako da može katalizirati i kaskadne reakcije. Nedavnom pojavom modela proteinskog jezika (engl. protein language models), metode koja se temelji na dubokom učenju, znanstvenicima je omogućeno da analiziraju i predviđaju svojstva proteina na temelju njihovih aminokiselinskih sekvenci. ProteinMPNN (engl. Protein Mechanics by Predicted Neural Networks) je primjer računalnog alata osmišljenog za optimizaciju proteinskih sekvenci kako bi se dobile željene strukture ili funkcije.

• Ključne riječi: enzimska kataliza; proteini
• Jezik: hrvatski
• URN:NBN: urn:nbn:hr:217:071356
• Projekt: Šifra: NPOO.C3.2.R2-I1.06.0041; Naziv: Enzimsko inženjerstvo za održivo recikliranje bioplastike; Naziv: Enzyme engineering for sustainable bioplastic recycling; Voditelj: Aleksandra Maršavelski; Pravna nadležnost: eu; Financijer: Europska komisija; Linija financiranja: The Recovery and Resilience Facility
• Studijski program: Naziv: Kemija; Vrsta studija: sveučilišni; Stupanj studija: prijediplomski; Akademski / stručni naziv: sveučilišni/a prvostupnik/prvostupnica (baccalaureus/baccalaurea) kemije (univ. bacc. chem.)
• Vrsta resursa: Tekst
• Način izrade datoteke: Izvorno digitalna
• Prava pristupa: Otvoreni pristup
• Datum i vrijeme pohrane: 2024-10-03 09:10:37