Genetika koi riba

završni rad

• Naslov (engleski): Koi fish genetics
• Autor: Tomas Čorak Grdović
• Mentor: Nenad Malenica (mentor)
• Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj: Sveučilište u Zagrebu; Prirodoslovno-matematički fakultet; (Biološki odsjek); Zagreb
• Datum i država obrane: 2024-09-10, Hrvatska
• Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana: PRIRODNE ZNANOSTI; Biologija

Sažetak

Koi ribe uzgojene su kao pasmine šarana u Japanu kroz zadnjih dvjesto godina. Unatoč njihovoj značajnoj komercijalnoj vrijednosti kao ukrasnih riba odlučujuće karakteristike za vrijednost pojedinih jedinki slabo su definirane te često ostavljene subjektivnoj procjeni sudaca. Kako bi se olakšao uzgoj te ujednačila karakterizacija traženih svojstava provode se istraživanja genetičke osnove istih. Neka od najznačajnijih fenotipskih svojstava uključuju obojenost, uzorke boje po tijelu, karakteristike ljuski, prekrivenost tijela ljuskama te veličinu peraja. Zbog velikog broja različitih pigmentiranih stanica te nedavne duplikacije genoma također služe kao odlični modeli za razna istraživanja u područjima evolucije genoma, embriologije, regulacije ekspresije gena te pigmentacije. U ovom radu napravljen je pregled strukture genoma koi šarana, diferencijalne ekspresije gena poput Mc1r, Foxd3 i Scarb1 te njihove regulacije pomoću miRNA te lncRNA molekula, s naglaskom na miR-206 za koju je ustanovljeno da diferencijalno regulira ekspresiju gena Mc1r. Obrađeni su i poznati mehanizmi nasljeđivanja fenotipova te gene kojima su regulirani, negativan utjecaj stroge selekcije te letalnost homozigota za određena tražena svojstva. Napravljen je i pregled razvoja različitih pigmentiranih stanica tijekom embriogeneze te pripadajućih biokemijskih puteva pigmentacije

Sažetak (engleski)

Koi fish have been developed as carp varieties in Japan throughout the past two hundred years via strict selective breeding. Despite their significant commercial value as ornamental fish, the decisive characteristics for the value of individuals are poorly defined and often left to the subjective assessment of different judges. In order to facilitate breeding and the uniformity of the characterization of valued traits, research on the genetic basis of these traits is being carried out. Some of the most significant traits include the coloration itself, colour patterns throughout the body, the characteristics of the scales, the coverage of the body with scales and the size of the fins. Due to the large number of different pigmented cells and the recent genome duplication event that koi are believed to be part of they also serve as excellent models for various research in the fields of genome evolution, embryology, gene expression regulation and pigmentation. This paper focuses on the overview of the structure of the koi carp genome, differential expression of genes such as Mc1r, Foxd3 and Scarb1 and their regulation by miRNA and lncRNA molecules, especially miR-206, which was found to differentially regulate the expression of the Mc1r gene. The known mechanisms of trait inheritance and the genes by which they are regulated, the negative impact of strict selection and the lethality of homozygotes for certain sought after traits are also discussed, as well as an overview of the development of various pigmented cells during embryogenesis and the associated biochemical pathways of pigmentation.

• Ključne riječi: miRNA; pigmentacija; koi; diferencijalna ekspresija gena
• Ključne riječi (engleski): miRNA; pigmentation; koi; differential gene expression
• Jezik: hrvatski
• URN:NBN: urn:nbn:hr:217:050703
• Studijski program: Naziv: Molekularna biologija; Vrsta studija: sveučilišni; Stupanj studija: prijediplomski; Akademski / stručni naziv: sveučilišni/a prvostupnik/prvostupnica (baccalaureus/baccalaurea) molekularne biologije (univ. bacc. biol. mol.)
• Vrsta resursa: Tekst
• Način izrade datoteke: Izvorno digitalna
• Prava pristupa: Otvoreni pristup
• Datum i vrijeme pohrane: 2024-10-03 09:54:31