Razvoj in vivo sustava za testiranje inhibicije triptofanil-tRNA sintetaze

diplomski rad

• Naslov (engleski): Development of an in vivo tryptofanyl-tRNA synthetase inhibition assay
• Autor: Kristian Subota
• Mentor: Marko Močibob (mentor)
• Član povjerenstva: Marko Močibob (predsjednik povjerenstva)
• Član povjerenstva: Petra Korać (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Ivana Ivančić Baće (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Inga Urlić (član povjerenstva)
• Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj: Sveučilište u Zagrebu; Prirodoslovno-matematički fakultet; (Biološki odsjek); Zagreb
• Datum i država obrane: 2025-02-07, Hrvatska
• Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana: PRIRODNE ZNANOSTI; Biologija

Sažetak

Aminoacil-tRNA-sintetaze (AaRS), predstavljaju dobru metu za razvoj novih antibiotika, jer
postoje značajne razlike između evolucijski očuvanih prokariotskih i eukariotskih enzima. Većina
bakterija koristi jednu konstitutivno eksprimiranu triptofanil-tRNA-sintetazu (TrpRS), no Bacillus
thuringiensis ima i bona fide inducibilnu TrpRS2, kojoj je zasad uloga nepoznata. U prijašnjim
istraživanjima na izoleucil-tRNA-sintetazi je pokazano da je IleRS2 inducibilna te daje bakterijama
otpornost na... Više mupirocin, dok konstitutivna verzija ima bolju učinkovitost u aminoacilaciji.
Postavljena je hipoteza da bi TrpRS2 mogla imati sličnu ulogu. Stoga je klonirana promotorska
regija gena za TrpRS2 iz B. thuringiensis u Bacillus subtilis s povezanim reporterskim genom
(lacZ). Ovaj sintetski sustav omogućio bi brzi probir prirodnih spojeva koji mogu inhibirati
triptofanil-tRNA-sintetazu, što bi moglo doprinijeti razvoju novih antibiotika. Do sada je u
kliničkoj primjeni samo tri inhibitora AaRS: mupirocin, halofuginon i tavaborol. Sakrij dio sažetka

Sažetak (engleski)

Aminoacyl-tRNA-synthetases (AaRS) represent a good target for the development of new
antibiotics, because there are significant differences between evolutionarily conserved prokaryotic
and eukaryotic enzymes. Most bacteria use one constitutively expressed tryptophanyl-tRNAsynthetase (TrpRS), but Bacillus thuringiensis also has a bona fide inducible TrpRS2, whose role
is currently unknown. In previous research, on isoleucyl-tRNA-synthetase, it was shown that
IleRS2 is responsible for... Više bacterial resistance to mupirocin, while the constitutive version has better
efficiency in aminoacylation. It was hypothesized that TrpRS2 might play a similar role. Therefore,
the promoter region of the TrpRS2 gene from B. thuringiensis was cloned into Bacillus subtilis
with an associated reporter gene (lacZ). This synthetic system would enable rapid screening of
natural compounds that can inhibit tryptophanyl-tRNA-synthetase, which could contribute to the
development of new antibiotics. So far, only three AaRS inhibitors are in clinical use: mupirocin,
halofuginone and tavaborole. Sakrij dio sažetka

• Ključne riječi: aminoacil-tRNA-sintetaze; antibiotici; genetičko inženjerstvo; triptofan
• Ključne riječi (engleski): aminoacyl-tRNA-synthetases; antibiotics; genetic engineering; tryptophan
• Jezik: hrvatski
• URN:NBN: urn:nbn:hr:217:154981
• Projekt: Šifra: IP-2022-10-1400; Naziv: Istraživanja aminoacil-tRNA-sintetaza kao antibiotskih meta i mehanizama kojima razvijaju rezistenciju; Naziv: Investigation of aminoacyl-tRNA syntetases as targets for antibiotics and how they develop resistance mechanisms; Kratica: ARSTARE; Voditelj: Ita Gruić-Sovulj; Pravna nadležnost: Hrvatska; Financijer: Hrvatska zaklada za znanost; Linija financiranja: Research Projects
• Studijski program: Naziv: Molekularna biologija; Vrsta studija: sveučilišni; Stupanj studija: diplomski; Akademski / stručni naziv: sveučilišni/a magistar/magistra molekularne biologije (univ. mag. biol. mol.)
• Vrsta resursa: Tekst
• Način izrade datoteke: Izvorno digitalna
• Prava pristupa: Otvoreni pristup
• Datum i vrijeme pohrane: 2025-02-27 12:22:09