Karakterizacija raspršenih elemenata alfa-satelitne DNA u ljudskom genomu

diplomski rad

• Naslov (engleski): Characterization of dispersed alpha-satellite DNA in human genome elements
• Autor: Doris Zorić
• Mentor: Đurđica Ugarković (mentor)
• Član povjerenstva: Đurđica Ugarković (predsjednik povjerenstva)
• Član povjerenstva: Zlatko Liber (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Goran Kovačević (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Petra Korać (član povjerenstva)
• Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj: Sveučilište u Zagrebu; Prirodoslovno-matematički fakultet; (Biološki odsjek); Zagreb
• Datum i država obrane: 2018-02-13, Hrvatska
• Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana: PRIRODNE ZNANOSTI; Biologija

Sažetak

Satelitne DNA su uzastopno ponavljajuće sekvence koje su prisutne u dugačkim neprekinutim nizovima u genetički utišanim heterokromatinskim regijama. Projekti sekvenciranja genoma pokazali su prisutnost i distribuciju ponavljanja satelitne DNA u eukromatinskom dijelu genoma u blizini samih gena, odnosno raspršenost elemenata satelitne DNA u genomu. Prisutnost funkcionalnih elemenata poput promotora i mjesta vezanja transkripcijskih faktora unutar nekih satelita doveli su do pretpostavke da satelitne DNA mogu djelovati kao cis-regulatorni elementi ekspresije gena. Cilj istraživanja jest utvrditi zastupljenost i distribuciju raspršenih elemenata alfa-satelitne DNA u ljudskom genomu, uočiti moguće polimorfizme u populaciji te ispitati regulatornu ulogu tih elemenata analizom metilacije DNA prije i nakon temperaturnog stresa.

Sažetak (engleski)

Satellite DNAs are tandemly repeated sequences present in long uninterupted arrays in genetically silenced heterochromatic regions. Genome sequencing projects revealed the presence and the distribution of repetitive satellite DNA in the vicinity of genes, or in other words, the dispersion of satellite DNA elements across the euchromatic portion of genome. The presence of functional elements such as promoters and transcription factors binding sites within a number of satelites led to assumption that satellite DNAs may act as gene expression cis-regulatory elements. The main goal of this research is to determine the abundance and the distribution of dispersed elements of alpha satellite DNA in human genome and to propose them as genetic polymorphisms in the population, as well as to investigate the potential regulatory role of those elements by DNA methylation analysis before and after the heat-shock treatment.

• Ključne riječi: alfa-satelitna DNA; cis-regulatorni elementi; insercijski polimorfizam; prilagodba na temperaturni stres
• Ključne riječi (engleski): alpha satellite DNA; cis-regulatory elements; insertion polymorphism; adaptation to heat stress
• Jezik: hrvatski
• URN:NBN: urn:nbn:hr:217:577864
• Studijski program: Naziv: Molekularna biologija; Vrsta studija: sveučilišni; Stupanj studija: diplomski; Akademski / stručni naziv: magistar/magistra molekularne biologije (mag. biol. mol.)
• Vrsta resursa: Tekst
• Način izrade datoteke: Izvorno digitalna
• Prava pristupa: Otvoreni pristup
• Datum i vrijeme pohrane: 2018-03-14 12:46:34