Rezistencija virusa ljudske imunodeficijencije tipa 1 na inhibitore integraze

diplomski rad

• Naslov (engleski): Resistance of human immunodeficiency virus type 1 to integrase inhibitors
• Autor: Ivan Prepeluh
• Mentor: Snježana Židovec Lepej (mentor)
• Član povjerenstva: Snježana Židovec Lepej (predsjednik povjerenstva)
• Član povjerenstva: Domagoj Đikić (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Marin Ježić (član povjerenstva)
• Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj: Sveučilište u Zagrebu; Prirodoslovno-matematički fakultet; (Biološki odsjek); Zagreb
• Datum i država obrane: 2017-03-10, Hrvatska
• Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana: PRIRODNE ZNANOSTI; Biologija

Sažetak

Cilj ovog istraživanja bio je analizirati mutacije povezane s rezistencijom HIV-a tipa 1 na antiretrovirusne lijekove tj. inhibitore integraze, reverzne transkriptaze i proteaze u neliječenih osoba zaraženih HIV-om i usporediti ih s mutacijama koje se pojavljuju u bolesnika s virološkim neuspjehom liječenja te usporediti interpretaciju biološke značajnosti detektiranih mutacija primjenom tri bioinformatička algoritma. Rezistencija HIV-a na antiretrovirusne lijekove određena je metodom populacijskog sekvenciranja regije pol genoma HIV-a. Primarne mutacije povezane s rezistencijom HIV-a na antiretrovirusne lijekove dokazane su u 2/20 (10%) neliječenih zaraženih osoba te u 6/20 (30%) neuspješno liječenih bolesnika. Primarne mutacije povezane s rezistencijom na inhibitore integraze (N155H i Q148R) koje uzrokuju križnu rezistenciju na raltegravir i dolutegravir detektirane su u dva liječena bolesnika. Rezistencija na nukleozidne inhibitore reverzne transkriptaze dokazana je u 4/11 (36,4%) liječenih bolesnika te u 2/19 (10,5%) neliječenih ispitanika. Primarne mutacije povezane s rezistencijom HIV-a na inhibitore proteaze nisu detektirane dok je primarna mutacija G140A, koja uzrokuje rezistenciju HIV-1 na nukleozidne inhibitore reverzne transkriptaze, pronađena kod jednog liječenog bolesnika. Najčešća primarna mutacija detektirana u ovom istraživanju je bila M148V/I koja uzrokuje rezistenciju na nukleozidne inhibitore reverzne transkriptaze. Ukupno 85% ispitanika bilo je zaraženo subtipom B HIV-a tipa 1. Rezultati ovog istraživanja prvi su dokaz rezistencije HIV-a na inhibitore integraze u Hrvatskoj. Mutacije povezane s rezistencijom HIV-a na antiretrovirusne lijekove koje se pojavljuju u neliječenih i liječenih osoba su različite, a postoje nesukladnosti pri interpretaciji njihove biološke značajnosti obzirom na različite bioinformatičke algoritme.

Sažetak (engleski)

The main goal of this experiment was to analyze mutations associated with resistance of HIV type 1 to antiretroviral drugs (integrase inhibitors, reverse transcriptase inhibitors and protease inhibitors) in treatment-naïve patients and compare them with mutations in treatment-experienced patients having virologic failure, and also compare interpretation of biological significance of these detected mutations with three bioinformatic algorithms. Resistance of HIV to antiretroviral drugs was detected by” populations-based” sequencing method of pol region of the HIV genome. Major mutations associated with HIV resistance to antiretroviral drugs were detected in 2/20 (10%) treatment naïve and in 6/20 (30%) patients having treatment failure. Major mutations associated with resistance to integrase inhibitors (N155H and Q148R) leading to cross-resistance between raltegravir and elvitegravir were detected in two treatment experienced patients. Resistance to nucleoside inhibitors of reverse transcriptase was detected in 4/11 (36,4%) treatment experienced patients and in 2/19 (10,5%) treatment naïve patients. Major mutations to protease inhibitors were not detected, while mutation G140A that causes HIV resistance to non- nucleoside inhibitors of reverse transcriptase was detected in one treatment experienced patient. The most common major mutation detected in this experiment was M148V/I that causes resistance to nucleoside reverse transcriptase inhibitors. 85% of all patients were infected with HIV-1 subtype B. The results of this experiment are the first one in Croatia referring to HIV resistance to integrase inhibitors. Mutations associated with HIV resistance to antiretroviral drugs in treatment naïve and experienced patients are different, and there are also nonconformities with interpretation of their biological significance depending on different bioinformatics algorithms.

• Ključne riječi: HIV-1; rezistencija; antiretrovirusni lijekovi; integraza
• Ključne riječi (engleski): HIV-1; resistance; antiretroviral drugs; integrase
• Jezik: hrvatski
• URN:NBN: urn:nbn:hr:217:007002
• Studijski program: Naziv: Molekularna biologija; Vrsta studija: sveučilišni; Stupanj studija: diplomski; Akademski / stručni naziv: magistar/magistra molekularne biologije (mag. biol. mol.)
• Vrsta resursa: Tekst
• Način izrade datoteke: Izvorno digitalna
• Prava pristupa: Otvoreni pristup
• Datum i vrijeme pohrane: 2017-04-20 12:07:21