Razlike u replikaciji DNA između podskupina difuznog B-velikostaničnog limfoma

diplomski rad

• Naslov (engleski): DNA replication differences between diffuse large B-cell lymphoma subtypes
• Autor: Biljana Sasi
• Mentor: Petra Korać (mentor)
• Član povjerenstva: Petra Korać (predsjednik povjerenstva)
• Član povjerenstva: Nada Oršolić (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Silvija Černi (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Vlatka Zoldoš (član povjerenstva)
• Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj: Sveučilište u Zagrebu; Prirodoslovno-matematički fakultet; (Biološki odsjek); Zagreb
• Datum i država obrane: 2015-07-03, Hrvatska
• Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana: PRIRODNE ZNANOSTI; Biologija

Sažetak

Difuzni B-velikostanični limfom (DLBCL) je neoplazma B-limfocita koja pokazuje karakterističan difuzni uzorak u zahvaćenom tkivu. Čini oko 30% slučajeva ne-Hodgkinskog limfoma u odraslih. Na temelju profila genske ekspresije, DLBCL je moguće podijeliti u podskupine GCB (skupina B-stanica koja se nalazi u germinativnom centru folikula limfnih čvorova) i ne-GCB (skupina B-stanica koja se ne nalazi u germinativnom centru folikula limfnih čvorova). Kod velikog broja slučajeva s DLBCL-om mogu se detektirati brojni genski rearanžmani, od kojih je najčešća translokacija gena BCL6, gena BCL2, te gena c-MYC. Cilj ovog rada je analiza promjena u količini transkripata gena uključenih u proces replikacije i ponovne uspostave kromatina kod podskupina DLBCL-a. Takve promjene imaju ulogu u smanjenoj preciznosti odvijanja replikacije što dovodi do nakupljanja velikog broja pogrešaka u tumorskim stanicama, te potencijalno do progresije tumora. Uz pomoć imunohistokemijskog algoritma prema Hans i sur., svi slučajevi DLBCL-a podijeljeni su u GCB i ne-GCB podskupinu. RNA je izolirana iz svih uzoraka i reverznom transkripcijom prevedena u cDNA. q-RT PCR analiza ekspresije gena DNMT1, PCNA, MCM2, MCM7, GMNN, CDT1, EZH2 i p300 pokazala je povećanu ekspresiju gena CDT1 i DNMT1 i smanjenu ekspresiju gena PCNA, MCM2, MCM7 i EZH2 u GCB podskupini u odnosu na ne-GCB podskupinu. Rezultati ukazuju na potencijalan doprinos promjena ekspresije CDT1, DNMT1 i MCM7 patogenezi DLBCL-a.

Sažetak (engleski)

Diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL) is a neoplasm of B-cells with a characteristic diffuse pattern of distribution. It accounts for approximately 30% of non-Hodgkin lymphomas in elderly. DLBCL can be stratified, based on gene expression profiling, into GCB (germinal centre B-cell like) and non-GCB (non-germinal centre B-cell like) subtypes. In most DLBCL cases, a large number of genetic rearrangements can be detected. The most frequent is BCL6 translocation, followed by translocations of BCL2 and c-MYC. The aim of this study was to analyse changes in the amount of proteins involved in the replication process and the chromatin reassembly mechanisms in DLBCL subtypes. These changes might be responsible for aberrations in replication accuracy which further leads to accumulation of additional mutations in tumor cells causing tumor progression. DLBCL cases were classified into GCB and non-GCB subtyes using immunohistochemical algorithm by Hans et al. RNA from all samples was extracted and converted to cDNA by reverse transcription. q-RT PCR analysis of DNMT1, PCNA, MCM2, MCM7, GMNN, CDT1, EZH2 and p300 expression showed an increased expression of CDT1 and DNMT1 as well as a decreased expression of PCNA, MCM2, MCM7 and EZH2 in GCB when compared with a non-GCB subtype. Results suggest contribution of replication and chromatin reassembly machinery components to DLBCL pathogenesis.

• Ključne riječi: DLBCL; B-stanice; GCB DLBCL; ABC (ne-GCB) DLBCL; CDT1; DNMT1; MCM7
• Ključne riječi (engleski): DLBCL; B-cells; GCB DLBCL; ABC (non-GCB) DLBCL; CDT1; DNMT1; MCM7
• Jezik: hrvatski
• URN:NBN: urn:nbn:hr:217:619027
• Studijski program: Naziv: Molekularna biologija; Vrsta studija: sveučilišni; Stupanj studija: diplomski; Akademski / stručni naziv: magistar/magistra molekularne biologije (mag. biol. mol.)
• Vrsta resursa: Tekst
• Način izrade datoteke: Izvorno digitalna
• Prava pristupa: Pristup korisnicima matične ustanove
• Datum i vrijeme pohrane: 2017-04-25 08:24:26