Raznolikost mitohondrijske DNA divlje mačke (Felis silvestris) u Hrvatskoj

diplomski rad

• Naslov (engleski): Diversity of mitochondrial DNA in wildcat (Felis silvestris)
• Autor: Mateja Jagić
• Mentor: Ana Galov (mentor)
• Član povjerenstva: Ana Galov (predsjednik povjerenstva)
• Član povjerenstva: Dunja Leljak-Levanić (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Zlatko Liber (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Antun Alegro (član povjerenstva)
• Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj: Sveučilište u Zagrebu; Prirodoslovno-matematički fakultet; (Biološki odsjek); Zagreb
• Datum i država obrane: 2014-12-11, Hrvatska
• Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana: PRIRODNE ZNANOSTI; Biologija

Sažetak

Divlja mačka (Felis silvestris) autohtona je i strogo zaštićena vrsta u Hrvatskoj, međutim objavljeno je vrlo malo znanstvenih podataka o hrvatskoj populaciji divlje mačke. Cilj ovog istraživanja bio je analizirati raznolikost kontrolne regije mitohondrijske DNA divlje mačke na području Hrvatske te usporediti dobivene haplotipove s haplotipovima domaće mačke (Felis catus). Istraživanje je provedeno na 41 uzorku divljih, te 38 uzoraka domaćih mačaka. Analiziran je slijed kontrolne regije mitohondrijske DNA duljine 814 parova baza, te je kod divlje mačke utvrđena prisutnost 22 polimorfna mjesta koji čine 11 različitih haplotipova. Haplotipska raznolikost analiziranih sljedova iznosila je 0,857 +/- 0,036, dok je nukleotidna raznolikost 0,017 +/- 0,009. Kod 38 uzoraka domaće mačke utvrđeno je 21 polimorfno mjesto koji čine 11 haplotipova. Haplotipska raznolikost analiziranih sljedova domaće mačke iznosila je 0,758 +/- 0,067, a nukleotidna 0,011 +/- 0,006. Među haplotipovima divlje i domaće mačke nema podudaranja. Na temelju dobivenih rezultata zaključujem da je genetička raznolikost kontrolne regije mitohondrijske DNA divlje mačke iz Hrvatske relativno visoka.

Sažetak (engleski)

Wildcat (Felis silvestris) is autochthonous and strictly protected species in Croatia; however there is almost none scientific data on Croatian wildcat population. The goal of this research was to investigate diversity of mitochondrial DNA control region of wildcat from Croatia and to compare identified haplotypes with haplotypes of domestic cat (Felis catus). A total of 41 samples of wildcats and 38 domestic cat samples were included in the research. I analysed 814 base pairs long control region sequences and in wildcat samples 22 polymorphic sites were identified yielding 11 different haplotypes. Haplotype diversity of analysed sequences was 0,857 +/- 0,036, while nucleotide diversity was 0,017 +/- 0,009. Among 38 domestic cats samples 21 polymorphic sites were identified yielding 11 haplotypes. Haplotype diversity of analysed sequences of domestic cats was 0,758 +/- 0,067, while nucleotide diversity was 0,011 +/- 0,006. There were no matches between wildcat and domestic cat haplotypes. Based on these results I conclude that mitochondrial DNA control region diversity of wildcat from Croatia is fairly high.

• Ključne riječi: divlja mačka; domaća mačka; genetička raznolikost; haplotip; polimorfno mjesto
• Ključne riječi (engleski): wildcat; domestic cat; genetic diversity; haplotype; polimorfic site
• Jezik: hrvatski
• URN:NBN: urn:nbn:hr:217:245119
• Studijski program: Naziv: Molekularna biologija; Vrsta studija: sveučilišni; Stupanj studija: diplomski; Akademski / stručni naziv: magistar/magistra molekularne biologije (mag. biol. mol.)
• Vrsta resursa: Tekst
• Način izrade datoteke: Izvorno digitalna
• Prava pristupa: Pristup korisnicima matične ustanove
• Datum i vrijeme pohrane: 2017-04-26 09:26:18