Genomic patterns of phenotypic adaptation in Italian wall lizard Podarcis siculus (Rafinesque-Schmaltz, 1810)

disertacija

• Naslov (hrvatski): Genomski obrasci fenotipske adaptacije primorske gušterice Podarcis siculus (Rafinesque-Schmaltz, 1810)
• Autor: Iva Sabolić
• Mentor: Anamaria Štambuk (mentor)
• Član povjerenstva: Mirjana Pavlica (predsjednik povjerenstva)
• Član povjerenstva: Martina Podnar Lešić (član povjerenstva)
• Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj: Sveučilište u Zagrebu; Prirodoslovno-matematički fakultet; (Biološki odsjek); Zagreb
• Datum i država obrane: 2021-02-04, Hrvatska
• Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana: PRIRODNE ZNANOSTI; Biologija
• Univerzalna decimalna klasifikacija (UDC): 57 - Biološke znanosti. Fizička antropologija. Bioraznolikost

Sažetak

Within a competitive exclusion experiment conducted in 1971, five pairs of Podarcis siculus lizards were transferred from islet Pod Kopište to a nearby islet of Pod Mrĉaru in the Adriatic Sea. In only 35 years the newly established population exhibited significant morphological and ecological changes. This study combines experimental common garden approach with population genomics tools to discriminate between plastic and genomic response in Pod Mrĉaru population. Crossing experiment in common garden pointed towards medium to high heritability of diverged phenotypic traits related to head shape, indicating they hold enough additive genetic variance to evolve under selection. Genotyping by sequencing elucidated genome-wide divergence between Pod Mrĉaru and Pod Kopište populations. 18 loci putatively under selection were found to be associated with divergent phenotypic traits in source and newly established population, and/or differences in ecological variables among multiple P. siculus populations, suggesting rapid genomic adaptation on the islet of Pod Mrĉaru.

Sažetak (engleski)

1971. godine pet pari gušterice Podarcis siculus je u sklopu istraţivanja kompetitivne ekskluzije prebaĉeno s otoĉića Pod Kopište na susjedni otoĉić Pod Mrĉaru u Jadranskom moru. U samo 35 godina nakon introdukcije novoustanovljena populacija je razvila znaĉajne ekološke i morfološke razlike. Ovo istraţivanje kombinira pokus zajedniĉkog okoliša s metodama populacijske genomike u svrhu razluĉivanja izmeĊu plastiĉnih i genomskih prilagodba u populaciji s otoka Pod Mrĉaru. Eksperiment kriţanja u zajedniĉkom okolišu je ukazao na srednje visoku nasljednost fenotipskih obiljeţja vezanih uz oblik glave, što sugerira da sadrţe dovoljno aditivne genetske varijabilnosti da evoluiraju pod utjecajem selekcije. Genotipiziranje putem sekvenciranja je pokazalo diferencijaciju na razini cijelog genoma izmeĊu populacija s Pod Mrĉaru i Pod Kopište. 18 lokusa identificiranih kao potencijalno pod utjecajem selekcije povezani su s divergirajućim fenotipskim obiljeţjima u ishodišnoj i novoustanovljenoj populaciji i/ili varijacijom u okolišnim ĉimbenicima meĊu mnogobrojnim nativnim populacijama P. siculus, što ukazuje na brzu genomsku adaptaciju populacije na otoku Pod Mrĉaru.

• Ključne riječi: Podarcis siculus; rapid evolution; common garden; heritability; population genomics; genomic adaptation
• Ključne riječi (engleski): Podarcis siculus; brza evolucija; zajedniĉki okoliš; nasljednost; populacijska genomika; genomska adaptacija
• Jezik: engleski
• URN:NBN: urn:nbn:hr:217:896917
• Datum promocije: 2021
• Studijski program: Naziv: Biologija; Vrsta studija: sveučilišni; Stupanj studija: poslijediplomski doktorski; Akademski / stručni naziv: doktor/doktorica znanosti, područje prirodnih znanosti, polje biologija (dr.sc.)
• Vrsta resursa: Tekst
• Način izrade datoteke: Izvorno digitalna
• Prava pristupa: Otvoreni pristup; Datum isteka embarga: 2023-02-04
• Datum i vrijeme pohrane: 2021-02-24 12:29:11