Ekspresijski profil gena BCL2 i njegovih regulatornih nekodirajućih molekula RNA u seroznom raku jajnika

diplomski rad

• Naslov (engleski): Expression profile of BCL2 gene and its regulatory non-coding RNAs in serous ovarian cancer
• Autor: Lara Božičević
• Mentor: Petar Ozretić (mentor)
• Mentor: Inga Urlić (sumentor)
• Član povjerenstva: Inga Urlić (predsjednik povjerenstva)
• Član povjerenstva: Mirela Sertić Perić (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Draginja Mrvoš-Sermek (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Vesna Petrović Peroković (član povjerenstva)
• Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj: Sveučilište u Zagrebu; Prirodoslovno-matematički fakultet; (Biološki odsjek); Zagreb
• Datum i država obrane: 2021-02-25, Hrvatska
• Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana: PRIRODNE ZNANOSTI; Biologija

Sažetak

Visoka smrtnost od seroznog raka jajnika visokog gradusa (HGSOC) uzrokovana je njegovim otkrivanjem u kasnoj fazi zbog izostanka ranih simptoma te nedostatka testova za rano otkrivanje. Zato je potrebno bolje razumjeti molekularne mehanizme njegovog nastanka, što može stvoriti nove dijagnostičke i terapijske pristupe. Ciljevi mog istraživanja bili su: na proširenom setu uzoraka HGSOC i kontrolnih uzoraka zdravih jajovoda metodom kvantitativne lančane reakcije polimerazom u stvarnom vremenu (qRT-PCR) odrediti ekspresiju gena regulatora apoptoze BCL2, njegovih transkripcijskih faktora GLI1 i GLI2, dviju molekula mikroRNA (miRNA) čiji je ciljni gen BCL2, miR-96-5p i miR-21-5p, te dviju dugih nekodirajućih RNA (lncRNA) koje također mogu vezati te miRNA, MALAT1 i XIST; na osnovu korelacija između ekspresija složiti mrežu odnosa mRNA–miRNA–lncRNA koja bi mogla objasniti epigenetsku regulaciju gena BCL2 pomoću nekodirajućih molekula RNA, te odrediti dijagnostičku vrijednost dobivenih ekspresija za razlikovanje tumorskog i zdravog tkiva. Rezultati su pokazali da je ekspresija gena BCL2 i GLI1 te obiju lncRNA bila značajno snižena, a ekspresija obiju miRNA povišena u raku jajnika. Analiza korelacija pokazala je da bi transkripcijski faktor GLI1 mogao imati važniju ulogu od GLI2 u regulaciji ekspresije BCL2 te da bi ȏs BCL2–miR-96-5p–XIST mogla biti uzrok snižene ekspresije gena BCL2 u HGSOC. Najveću dijagnostičku vrijednost pokazale su ekspresije BCL2 i XIST (AUC > 0,8).

Sažetak (engleski)

High mortality from high-grade serous ovarian cancer (HGSOC) is caused by its late detection due to the absence of early symptoms and lack of tests for early detection. Therefore, it is necessary to better understand molecular mechanisms of its development, which could create new diagnostic and therapeutic approaches. The goals of my research were: to determine by real-time quantitative reverse transcription polymerase chain reaction (qRT-PCR), on an extended set of HGSOC and healthy fallopian tube samples, expressions of apoptosis regulator gene BCL2, its transcription factors GLI1 and GLI2, two microRNAs (miRNAs) that can target BCL2, miR-96-5p and miR-21-5p, and two long non-coding RNAs (lncRNAs) that can also bind these miRNAs, MALAT1 and XIST; based on the correlations between determined expressions, to construct a network of mRNAs–miRNAs–lncRNAs that could explain epigenetic regulation of BCL2 by non-coding RNAs, and to determine diagnostic value of these expressions for discrimination between tumor and healthy tissue. Results showed that expressions of BCL2, GLI1, and both lncRNAs were significantly decreased, while expressions of both miRNAs were increased in ovarian cancer. Correlation analysis showed that transcription factor GLI1 could play more important role than GLI2 in BCL2 expression regulating, and that BCL2–miR-96-5p–XIST axis could be the cause for decreased BCL2 expression in HGSOC. Expressions of BCL2 and XIST showed highest diagnostic values (AUC> 0.8).

• Ključne riječi: rak jajnika; gen BCL2; mikroRNA; lncRNA; ekspresija; qRT-PCR
• Ključne riječi (engleski): ovarian cancer; BCL2; microRNA; lncRNA; gene expression; qRT-PCR
• Jezik: hrvatski
• URN:NBN: urn:nbn:hr:217:483560
• Studijski program: Naziv: Biologija i kemija; smjerovi: nastavnički; Smjer: nastavnički; Vrsta studija: sveučilišni; Stupanj studija: integrirani preddiplomski i diplomski; Akademski / stručni naziv: magistar/magistra edukacije biologije i kemije (mag. educ. biol. et chem.)
• Vrsta resursa: Tekst
• Način izrade datoteke: Izvorno digitalna
• Prava pristupa: Otvoreni pristup; Datum isteka embarga: 2023-02-25
• Datum i vrijeme pohrane: 2021-03-08 14:46:42