Uloga polimorfizama gena KRAS na mjestima vezanja mikro RNA u tumorigenezi sporadičnih karcinoma debeloga crijeva

disertacija

• Naslov (engleski): The role of KRAS polymorphisms in micro RNA binding sites in sporadic colon cancer tumorigenesis
• Autor: Mirko Poljak
• Mentor: Sanja Kapitanović (mentor)
• Član povjerenstva: Maja Matulić (predsjednik povjerenstva)
• Član povjerenstva: Maja Sirotković-Skerlev (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Anita Škrtić (član povjerenstva)
• Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj: Sveučilište u Zagrebu; Prirodoslovno-matematički fakultet; (Biološki odsjek); Zagreb
• Datum i država obrane: 2021-03-24, Hrvatska
• Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana: PRIRODNE ZNANOSTI; Biologija
• Univerzalna decimalna klasifikacija (UDC): 577 - Biokemija. Molekularna biologija. Biofizika

Sažetak

Mutacija gena KRAS jedna je od ključnih promjena u tumorigenezi karcinoma debelog crijeva, međutim i pojačana ekspresija proteina KRAS može imati sličan učinak na proliferaciju tumorskih stanica. Cilj ovog istraživanja bio je ispitati ulogu let-7a i miR-544 te polimorfizama gena KRAS na mjestima vezanja za mikro RNA u tumorigenezi sporadičnih karcinoma kolona bez mutacije gena KRAS. Od svih tumora bez mutacije gena KRAS 62,0 % je bilo pozitivno na protein KRAS te je dokazana značajna razlika u ekspresiji između središta tumora i invazivne fronte tumora kako u postotku pozitivnih stanica tako i u razini ekspresije proteina KRAS. Nije dokazana razlika u ekspresiji mRNA KRAS i let-7a između normalnog i tumorskog tkiva, međutim ekspresija miR-544 je bila značajno niža u uzorcima invazivne fronte tumora. U korelaciji s ekspresijom proteina KRAS ekspresija miR-544 bila je značajno snižena u uzorcima invazivne fronte tumora pozitivnih na protein KRAS. Dokazana je povezanost polimorfizma let-7a, ali ne i polimorfizma miR-544 i ekspresije proteina KRAS. Naši rezultati sugeriraju povezanost polimorfizma KRAS-LCS6 i ekspresije miR-544 u regulaciji ekspresije proteina KRAS u sporadičnim tumorima debelog crijeva negativnim na mutaciju gena KRAS.

Sažetak (engleski)

KRAS is one of the key players in CRC tumorigenesis. Although it is known that KRAS mutations are a dominant event in CRC tumorigenesis, KRAS overexpression can have a similar effect on cell proliferation and can be regulated by miRNAs. The aim of this study was to examine the role of let-7a and miR-544 and KRAS polymorphisms in microRNA binding sites in sporadic colon cancer negative to KRAS mutations. In tumors negative to KRAS mutations 62.0 % were positive for KRAS protein expression and there was a significant difference between tumor centre and invasive tumor front in the percentage of positive tumor cells as well as in the intensity of KRAS protein expression. Even though there was no diffrerence in KRAS mRNA and let-7a expression between normal and tumor tissues, expression of miR-544 was significantly decreased in invasive tumor front. When correlated with protein expression, miR-544 was significantly lower in invasive tumor front, but only in tumors positive to KRAS protein. Association was found for let-7a polymorphism and KRAS protein expression but not for miR-544 polymorphism. Our results suggest the role of KRAS-LCS6 polymorphism and miR-544 expression in regulation of KRAS protein expression in sporadic colon cancers negative to KRAS mutations.

• Ključne riječi: sporadični karcinom debelog crijeva; KRAS; SNP; miRNA; let-7a; miR-544
• Ključne riječi (engleski): sporadic colon cancer; KRAS; SNP; miRNA; let-7a; miR-544
• Jezik: hrvatski
• URN:NBN: urn:nbn:hr:217:148023
• Datum promocije: 2021
• Studijski program: Naziv: Biologija; Vrsta studija: sveučilišni; Stupanj studija: poslijediplomski doktorski; Akademski / stručni naziv: doktor/doktorica znanosti, područje prirodnih znanosti, polje biologija (dr.sc.)
• Vrsta resursa: Tekst
• Način izrade datoteke: Izvorno digitalna
• Prava pristupa: Otvoreni pristup; Datum isteka embarga: 2023-03-24
• Datum i vrijeme pohrane: 2021-04-13 08:17:30