Utjecaj iona metala na aktivnost adenilosukcinat-sintetaze iz bakterije Helicobacter pylori; Priča o želatini i voću

diplomski rad

• Naslov (engleski): Effect of metal ions on activity of adenylosuccinate synthetase from bacterium Helicobacter pylori; The story of gelatin and fruit
• Autor: Karla Srnec
• Mentor: Ivana Leščić Ašler (mentor)
• Mentor: Draginja Mrvoš-Sermek (mentor)
• Član povjerenstva: Jasmina Rokov Plavec (predsjednik povjerenstva)
• Član povjerenstva: Draginja Mrvoš-Sermek (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Ivana Biljan (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Tajana Begović (član povjerenstva)
• Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj: Sveučilište u Zagrebu; Prirodoslovno-matematički fakultet; (Kemijski odsjek); Zagreb
• Datum i država obrane: 2021-07-22, Hrvatska
• Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana: PRIRODNE ZNANOSTI; Kemija

Sažetak

Ovaj diplomski rad sastoji se od dva dijela: istraživačkog i metodičkog. U istraživačkom
dijelu rada pročišćene su tri varijante enzima adenilosukcinat-sintetaze (AdSS) iz bakterije
Helicobacter pylori: AdSS obilježen histidinskim privjeskom, AdSS kojem je aspartat 12
zamijenjen alaninom i AdSS kojem je aspartat 12 zamijenjen asparaginom. Za pročišćavanje
su korištene kromatografija ionske izmjene, afinitetna kromatografija i gel filtracija.
Proteinima su potom mjerene specifične aktivnosti, a za obiljeţen AdSS određeni su kinetički
parametri uz promjenjivu koncentraciju iona Mg2+ koristeći Michaelis-Menten model
enzimske kinetike. Konačno, ispitan je utjecaj različitih iona metala na aktivnost obilježenog
AdSS.
U metodiĉkom dijelu rada pod naslovom „Priča o želatini i voću“ izrađena je metodičkodidaktička
priprema za učenike četvrtog razreda gimnazije. Metodička priprema temeljena je
na obrazovnim ishodima, najčešćim učeničkim krivim shvaćanjima i na uvodu u relevantnu
literaturu. Pripremljeni materijal namijenjen je obrazovnoj strategiji učenja otkrivanjem.

Sažetak (engleski)

This Diploma thesis consists of two parts: the research and methodological part. In the
experimental part of diploma work, three variants of enzyme adenylosuccinate synthetase
(AdSS) from bacterium Helicobacter pylori were purified: AdSS with histidine tag, AdSS
with aspartate 12 changed to alanine and AdSS with aspartate 12 changed to asparagine. Ion
exchange, affinity and gel filtration chromatographies were used for purification. Specific
activity was measured for each enzyme variant, and for tagged AdSS kinetic parameters were
also determined, by changing Mg2+ ions concentration, and using Michaelis-Menten model of
enzyme kinetics. Finally, the effect of different metal ions on tagged AdSS activity was
investigated.
In the methodological part under the title “The story of gelatin and fruit” a didacticmethodological
preparation was made for fourth grade high school students. The
methodological preparation is based on the educational outcomes, common misconceptions
held by students and with an insight in a revelant literature. The prepared material is intended
for educational strategy of learning by discovery.

• Ključne riječi: adenilosukcinat-sintetaza; enzimi; enzimska kinetika; Helicobacter pylori; pročišćavanje proteina; učenje otkrivanjem; želatina.
• Ključne riječi (engleski): adenylosuccinate synthetase; enzyme kinetics; enzymes; gelatin; Helicobacter pylori; learning by discovery
• Jezik: hrvatski
• URN:NBN: urn:nbn:hr:217:552993
• Projekt: Šifra: IP-2019-04-6764; Naziv: Alosterički komunikacijski putevi u oligomernim enzimima; Naziv: Allosteric communication pathways in oligomeric enzymes; Kratica: ALOKOMP/ALOCOMP; Voditelj: Zoran Štefanić; Pravna nadležnost: Hrvatska; Financijer: HRZZ; Linija financiranja: IP
• Studijski program: Naziv: Kemija (jednopredmetni); smjerovi: nastavnički; Smjer: nastavnički; Vrsta studija: sveučilišni; Stupanj studija: diplomski; Akademski / stručni naziv: magistar/magistra edukacije kemije (mag.educ.chem.)
• Vrsta resursa: Tekst
• Način izrade datoteke: Izvorno digitalna
• Prava pristupa: Otvoreni pristup; Datum isteka embarga: 2022-07-22
• Datum i vrijeme pohrane: 2021-09-10 13:56:06