Proteinski motivi i klasifikacija proteinskih familija

diplomski rad

• Naslov (engleski): Protein motifs and classification of protein families
• Autor: Kristin Kokan
• Mentor: Pavle Goldstein (mentor)
• Član povjerenstva: Pavle Goldstein (predsjednik povjerenstva)
• Član povjerenstva: Snježana Lubura Strunjak (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Josip Tambača (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Zvonimir Bujanović (član povjerenstva)
• Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj: Sveučilište u Zagrebu; Prirodoslovno-matematički fakultet; (Matematički odsjek); Zagreb
• Datum i država obrane: 2023-11-27, Hrvatska
• Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana: PRIRODNE ZNANOSTI; Matematika

Sažetak

Ovaj diplomski rad bavi se promatranjem MADS-box familije transkripcijskih faktora. Cilj rada je povećati točnost metode pronalaženja MADS-box motiva u biljnim proteomima i, ujedno, proučiti filogenetsku strukturu MADS-box familije. Promatrano je sedam biljnih proteoma, gdje se MADS-box familiju tražilo s dva karakteristična motiva različitih duljina. Ispostavlja se da je filogenetska struktura MADS-box familije nezavisna od izbora motiva za pretragu. Isto tako, djelomično je potvrđeno poznato opažanje o različitoj strukturi MADS-box familije u divljih i uzgajanih biljaka, uz nekoliko značajnih izuzetaka.

Sažetak (engleski)

This thesis examines the MADS-box family of transcription factors. The aim of the thesis is to improve the accuracy of the search method of MADS-box motifs in plant proteomes and, simultaneously, to study the phylogenetic structure of the MADS-box family. We examined seven plant proteomes, where we searched for the MADS-box family using two characteristic motifs of different lengths. It turns out that the phylogenetic structure of the MADS-box family is independent of the motif selection for the search. Likewise, the known observation of the different structure of the MADS-box family in wild and cultivated plants has been partially confirmed, with a few significant exceptions.

• Ključne riječi: MADS-box familija transkripcijskih faktora; biljni proteomi; divlje biljake; uzgajane biljake
• Ključne riječi (engleski): MADS-box family of transcription factors; plant proteomes; wild plants; cultivated plants
• Jezik: hrvatski
• URN:NBN: urn:nbn:hr:217:472607
• Studijski program: Naziv: Matematička statistika; Vrsta studija: sveučilišni; Stupanj studija: diplomski; Akademski / stručni naziv: sveučilišni magistar matematike (univ. mag. math.)
• Vrsta resursa: Tekst
• Način izrade datoteke: Izvorno digitalna
• Prava pristupa: Otvoreni pristup
• Datum i vrijeme pohrane: 2024-02-12 12:36:36