Ferocenski biokonjugati s aminokiselinama i ugljikohidratima

disertacija

• Naslov (engleski): Ferrocene bioconjugates with amino acids and carbohydrates
• Autor: Monika Kovačević; MBZ: 296286
• Mentor: Lidija Barišić (mentor); MBZ: 219514
• Član povjerenstva: Srđanka Tomić-Pisarović (predsjednik povjerenstva)
• Član povjerenstva: Lidija Barišić (član povjerenstva); MBZ: 219514
• Član povjerenstva: Silvana Raić-Malić (član povjerenstva)
• Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj: Sveučilište u Zagrebu; Prirodoslovno-matematički fakultet; (Kemijski odsjek); Zagreb
• Datum i država obrane: 2014-09-19, Hrvatska
• Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana: PRIRODNE ZNANOSTI; Kemija
• Univerzalna decimalna klasifikacija (UDC): 54 - Kemija. Kristalografija. Mineralogija

Sažetak

U prvom dijelu rada opisana je sinteza i konformacijska svojstva biokonjugata 21-32 [izvedenih kondenzacijom ferocen-1,1-diamina (Fcda) i prirodnih peptida Ala-Pro i Pro-Ala] i njihovih prekursora 1-14. Pripravljeni spojevi podvrgnuti su spektroskopskoj analizi (IR-, NMR- i CD-spektroskopija) i DFT-modeliranju da bi se ispitao utjecaj slijeda i kiralnosti prirodnih aminokiselina te N-terminalnih zaštitnih skupina na njihov konformacijski prostor. Pokazalo se da (i) peptidi 21-32 [Y-(AA) n-NH-Fn-NH-(AA)m-Y, Fn = ferocenilen, AA = D(L)-Pro, D(L)-Ala, Y = Ac (acetil), Boc (tert-butoksikarbonil), m,n = 1, 2] uspostavljaju interlančane intramolekulske vodikove veze (IHB) kojima se induciraju ß- i -okreti te (ii) da se promjena kiralnosti i slijeda prirodnih aminokiselina kao i zaštitnih skupina odražava na IHB-obrasce. U drugom dijelu disertacije, posvećenom konjugatima ferocenâ s ugljikohidratima, opisana je sinteza ferocenskih muropeptida N-Ac-(izo)Mur-NH-Fn-R, (44-48, Mur = muraminska kiselina, R = H, COOMe, NHAc) te konjugata N-Ac-Mur-L(D)-Ala-Fca-OMe (49-52), analoga muramildipeptida (MDP, N-Ac-Mur-Ala-izoGln). Spektroskopskom analizom potkrijepljenom DFT-računima utvrđen je utjecaj organometalnog fragmenta na konformacijska svojstva rezultirajućih konjugata. Nadalje, opisana je sinteza esterskih (61-66) i amidnih konjugata ferocenâ i manoze (67-72) koji su se pokazali inhibitorima hemaglutinacije Escherichie coli.

Sažetak (engleski)

In the first part of this dissertation the synthesis and conformational analysis of bioconjugates 21-32 [derived by condensation of ferrocene-1,1-diamine (Fcda) with natural peptides Ala-Pro and Pro-Ala] and their precursors 1-14 are described. In order to explore the impact of chirality and sequence of amino acids, as well as effect of N-protecting groups on conformational space of prepared compounds, the detailed conformational analysis (IR, NMR and CD spectroscopy, DFT calculations) was performed. It was demonstrated that (i) peptides 21-32 [Y-(AA) n -NH-Fn-NH-(AA)-Y, Fn = ferrocenylene, AA = D(L)-Pro, D(L)-Ala, Y = Ac(acetyl), Boc (tert-butoxycarbonyl), m,n = 1, 2] form ß- and -turns through intermolecular m hydrogen bonding (IHB) and (ii) chirality and sequence of amino acids as well as protecting groups affect the IHB motifs. In the second part of this dissertation, dealing with bioconjugates of ferrocenes and carbohydrates, the synthesis of ferrocene muropeptides N-Ac-(iso)Mur-NH-Fn-R, (44-48, Mur = muramic acid, R = H, COOMe, NHAc) and conjugates N-Ac-Mur-L(D)-Ala-Fca-OMe (49-52), an analogues of muramyl dipeptide (MDP, N-Ac-Mur-Ala-isoGln), was desribed. The influence of an organometallic moiety on the conformational properties of the synthesized compounds was examined by spectroscopic analysis corroborated with DFT modeling. Furthermore, the synthesis and inhibitory potency of ester and amide conjugates of ferrocene and mannose (67-72) toward Escherichia coli were presented.

• Ključne riječi: DFT; ferocen; intramolekulska vodikova veza; konformacijska analiza; manozidi; muropeptidi; peptidi
• Ključne riječi (engleski): DFT; ferrocene; intramolecular hydrogen bonds; conformational analysis; mannosides; muropeptides; peptides
• Jezik: hrvatski
• URN:NBN: urn:nbn:hr:217:816836
• Studijski program: Naziv: Kemija; Vrsta studija: sveučilišni; Stupanj studija: poslijediplomski doktorski; Akademski / stručni naziv: doktor/doktorica znanosti, područje prirodnih znanosti, polje kemija (dr. sc.)
• Vrsta resursa: Tekst
• Opseg: 275 str. ; 30 cm
• Način izrade datoteke: Izvorno digitalna
• Prava pristupa: Otvoreni pristup
• Datum i vrijeme pohrane: 2017-02-15 13:13:27