Identifikacija i karakterizacija citokroma P450 obitelji 4 u dagnji, Mytilus galloprovincialis

disertacija

• Naslov (engleski): Identification and characterization of cytochrome P450 family 4 in the mussel, Mytilus galloprovincialis
• Autor: Sanda Ravlić; MBZ: 305793
• Mentor: Maja Fafanđel (mentor); MBZ: 218864
• Član povjerenstva: Nevenka Bihari (predsjednik povjerenstva)
• Član povjerenstva: Tvrtko Smital (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Goran Klobučar (član povjerenstva)
• Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj: Sveučilište u Zagrebu; Prirodoslovno-matematički fakultet; (Geološki odsjek); Zagreb
• Datum i država obrane: 2014-07-15, Hrvatska
• Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana: PRIRODNE ZNANOSTI; Interdisciplinarne prirodne znanosti; Znanost o moru
• Univerzalna decimalna klasifikacija (UDC): 55 - Geologija. Meteorologija. Hidrologija

Sažetak

Enzimi citokroma P450 (CYP) čine važnu komponentu staničnog sustava detoksifikacije. U dagnji, Mytilus galloprovincialis, s različitih lokacija, identificirano je i karakterizirano sedam novih eksprimiranih grupa gena citokroma P450. Filogenetska analiza enzima citokroma P450 pokazala je grupiranje eksprimiranih gena unutar CYP4 monofiletske grupe. Usporedba prevedenih CYP4 aminokiselinskih sljedova dagnje sa CYP4 sljedovima kralješnjaka i beskralješnjaka pokazala je visoki stupanj očuvanja aminokiselina u domenama bitnim za funkcionalnost enzima. Identificirane genske grupe, od kojih svaka sadrži niz genskih varijanti, imenovane su CYP4Y1, Y2, Y3, Y4, Y5, Y6 i Y7. Grupe gena CYP4Y2 i Y7 te CYP4Y5 i Y6 pokazale su mjesnu specifičnost, dok je prisutnost genskih grupa CYP4Y1, Y3 i Y4 uočena na svim lokacijama uzorkovanja. Dobiveni rezultati ukazuju na veliku ekspanziju genske obitelji CYP4Y u dagnji, vjerojatno kao posljedicu različitih uvjeta u okolišu. Podatci koji se odnose na raznovrsnost gena cyp4y mogli bi predstavljati dobru osnovu za buduća istraživanja usmjerena na poboljšanje primjene citokroma P450 kao biomarkera onečišćenja okoliša.

Sažetak (engleski)

Cytochrome P450 enzymes (CYPs) are essential components of cellular detoxification system. In this study seven new cytochrome P450 gene clusters from bivalve mollusc Mytilus galloprovincialis from different collection sites were identified and characterized. The phylogenetic analysis demonstrated that the identified sequences were clustered within the CYP4 branch. The deduced amino acid sequences showed high conservation of the residues and domains essential to the function of the enzyme. Identified gene transcripts corresponded to seven different gene clusters, each comprising a number of allelic variants, which were designated CYP4Y1, Y2, Y3, Y4, Y5, Y6 and Y7. Gene clusters CYP4Y2 and Y7, and CYP4Y5 and Y6 were site specific, while the gene clusters CYP4Y1, Y3 and Y4 were present at all investigated locations. Great expansion of the CYP4Y gene subfamily in the mussel M. galloprovincialis could be attributed to different environmental conditions. Data concerning diversity of CYP4Y genes could present a good base in further investigations for improvement of cytochrome P450 application as biomarker of marine environmental pollution.

• Ključne riječi: citokrom P450; cDNA kloniranje; filogenetska analiza; okoliš; školjkaši
• Ključne riječi (engleski): cytochrome P450; cDNA cloning; phylogenetic analysis; environment; bivalvia
• Jezik: hrvatski
• URN:NBN: urn:nbn:hr:217:510934
• Studijski program: Naziv: Interdisciplinarni doktorski studiji iz oceanologije; Vrsta studija: sveučilišni; Stupanj studija: poslijediplomski doktorski; Akademski / stručni naziv: doktor/doktorica znanosti, područje prirodnih znanosti, polje interdisciplinarne prirodne znanosti (znanost o moru) (dr.sc.)
• Vrsta resursa: Tekst
• Opseg: 112 (+XII) str. ; 30 cm
• Način izrade datoteke: Izvorno digitalna
• Prava pristupa: Otvoreni pristup
• Javna napomena: Doktorska disertacija izrađena je u Centru za istraživanje mora Instituta Ruđer Bošković u Rovinju, u sklopu navedenog studija.
• Datum i vrijeme pohrane: 2017-02-17 11:33:01