Karakteristike i primjene različitih tipova alata CRISPR-Cas

završni rad

• Naslov (engleski): Characteristics and applications of different types of CRISPR-Cas tools
• Autor: Iva Verbanac
• Mentor: Ivana Ivančić Baće (mentor)
• Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj: Sveučilište u Zagrebu; Prirodoslovno-matematički fakultet; (Biološki odsjek); Zagreb
• Datum i država obrane: 2022-09-22, Hrvatska
• Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana: PRIRODNE ZNANOSTI; Biologija

Sažetak

Adaptivna imunost kod bakterija i arheja ili pod akronimom poznat sustav CRISPR-Cas (engl.
clustered regularly interspaced short palindromic repeats-CRISPR associated proteins)
prenamijenjen je u trenutno najkorišteniji genetički alat. Njegova je posebnost u tome što
specifično prepoznaje sekvence RNA ili DNA prema sekvenci molekule RNA koja ga vodi pa
omogućava precizno djelovanje alata. U ovom su radu predstavljeni alati dizajnirani na temelju
sustava CRISPR-Cas iz klase 2. Klasa 2 pogodna je za manipulaciju kod dizajna alata zbog toga
što posjeduje jedan efektorski protein. Efektorski proteini unutar klase 2 su Cas9 i Cas12 koji
prepoznaju dvolančanu DNA i Cas13 koji prepoznaje jednolančanu RNA. Svaki od efektorskih
proteina posjeduje specifičan mehanizam djelovanja zbog kojeg je pogodniji za određen tip alata.
Naravno, dizajn svakog genetičkog alata sa sobom nosi pregršt problema poput unosa u stanice i
nespecifično djelovanje (off-target) koji su diskutirani u ovom radu.

Sažetak (engleski)

Bacterial and archaeal adaptive immunity or system more known as CRISPR-Cas (clustered
regularly interspaced short palindromic repeats-CRISPR associated proteins) was repurposed in
currently the most used genetic tool. The system can specifically target an RNA or DNA sequence
because it is guided by an RNA molecule which enables tool precision. This paper represents
different tools based on class 2 CRISPR-Cas system. The class 2 is better suited as a tool because
it has a single effector protein. Class 2 effector proteins are Cas9 and Cas12 which bind dsDNA
and Cas13 which binds ssRNA. Each of these effector proteins has its unique mechanism of action
which makes it more convenient for a specific type of a genetic tool. Moreover, designing a genetic
tool brings a handful of problems such as delivery into cells and off-target activity both discussed
in this paper.

• Ključne riječi: genetičko inženjerstvo; endonukleaza; efektorski proteini; CRISPR-Cas
• Ključne riječi (engleski): gene engineering; endonuclease; effector protein; CRISPR-Cas
• Jezik: hrvatski
• URN:NBN: urn:nbn:hr:217:350291
• Studijski program: Naziv: Molekularna biologija; Vrsta studija: sveučilišni; Stupanj studija: preddiplomski; Akademski / stručni naziv: sveučilišni/a prvostupnik/prvostupnica (baccalaureus/baccalaurea) molekularne biologije (univ. bacc. biol. mol.)
• Vrsta resursa: Tekst
• Način izrade datoteke: Izvorno digitalna
• Prava pristupa: Otvoreni pristup
• Datum i vrijeme pohrane: 2022-10-05 09:28:04