Simetrični poliini izvedeni iz bis-triarilamina kao fluorescentni senzori za DNA i RNA

diplomski rad

• Naslov (engleski): Symmetrical polyynes derived from bis-triarylamine as fluorescence sensor for DNA and RNA
• Autor: Nina Vukadinović
• Mentor: Dijana Pavlović Saftić (mentor)
• Član povjerenstva: Iva Juranović Cindrić (predsjednik povjerenstva)
• Član povjerenstva: Đani Škalamera (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Mirta Rubčić (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Ivan Nemet (član povjerenstva)
• Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj: Sveučilište u Zagrebu; Prirodoslovno-matematički fakultet; (Kemijski odsjek); Zagreb
• Datum i država obrane: 2024-10-16, Hrvatska
• Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana: PRIRODNE ZNANOSTI; Kemija

Sažetak

Fluorescentne probe za analitičke svrhe su ključne za napredak u gotovo svim područjima prirodnih znanosti, a vrlo često pronalaze primjenu u specifičnoj detekciji polinukleotida. U okviru ovog rada provedena je spektroskopska karakterizacija pet spojeva izvedenih iz bis-triarilamina primjenom UV/Vis i fluorescencijske spektroskopije. Ispitan je utjecaj supstituenata na afinitet i način vezanja na prirodnu DNA te sintetske molekule DNA i RNA. Obradom fluorimetrijskih titracija pomoću Scatchardove jednadžbe metodom nelinearne regresijske analize dobivene su konstante stabilnosti kompleksa proba s polinukleotidima. Eksperimenti temperaturnog mekšanja polinukleotida i titracije metodom cirkularnog dikroizma su pokazali visok afinitet spojeva prema polinukleotidima, bez značajne selektivnosti prema specifičnim sekvencama. Dodatak ovih spojeva dvolančanim molekulama obično je rezultirao slabijom (de)stabilizacijom heliksa, osim jednog spoja koji je blago stabilizirao određeni tip DNA. Dobiveni rezultati ukazuju na potencijal ovih spojeva kao fluorescentnih senzora u biološkim istraživanjima.

Sažetak (engleski)

Fluorescent probes for analytical purposes are crucial for advancements in nearly all fields of natural sciences and are often used for the specific detection of polynucleotides. This study involved the spectroscopic characterization of five compounds derived from bis-triarylamines using UV/Vis and fluorescence spectroscopy. The influence of substituents on the affinity and binding mode to natural DNA and synthetic DNA and RNA molecules was investigated. Analysis of fluorimetric titrations using the Scatchard equation with nonlinear regression methods provided stability constants for the complexes with polynucleotides. Experiments on the thermal melting of polynucleotides and circular dichroism titrations demonstrated a high affinity of the compounds for polynucleotides, with no significant selectivity towards specific sequences. The addition of these compounds to double-stranded molecules generally resulted in weaker stabilization of the helix, except for one compound, which slightly stabilized a specific type of DNA. The results indicate the potential of these compounds as fluorescent sensors in biological research.

• Ključne riječi: bis-triarilamini; cirkularni dikroizam; DNA; fluorescentne probe; UV/Vis
• Ključne riječi (engleski): bis-triarylamines; circular dichroism; DNA; fluorescent probes; UV/Vis
• Jezik: hrvatski
• URN:NBN: urn:nbn:hr:217:725000
• Projekt: Šifra: IP-2022-10-9829; Naziv: Novi peptid-oligonukleotid-kromofor konjugati za biokemijsku dijagnostiku i bioaktivnost; Naziv: New peptide-oligonucleotide-chromophore conjugates for biochemical diagnostics and bioactivity; Kratica: POC-Sens-Bioact; Voditelj: Ivo Piantanida; Pravna nadležnost: Hrvatska; Financijer: Hrvatska zaklada za znanost; Linija financiranja: Research Projects
• Studijski program: Naziv: Kemija; smjerovi: Istraživački; Smjer: Istraživački; Vrsta studija: sveučilišni; Stupanj studija: diplomski; Akademski / stručni naziv: sveučilišni/a magistar/magistra kemije (univ. mag. chem.)
• Vrsta resursa: Tekst
• Način izrade datoteke: Izvorno digitalna
• Prava pristupa: Otvoreni pristup
• Datum i vrijeme pohrane: 2024-10-24 12:52:07