DNA barkodiranje kao metoda u taksonomskoj identifikaciji biljnih i životinjskih vrsta

diplomski rad

• Naslov (engleski): DNA barcoding as a method in taxonomical identification of plant and animal species
• Autor: Jakob Ćosić
• Mentor: Damjan Franjević (mentor)
• Član povjerenstva: Damjan Franjević (predsjednik povjerenstva)
• Član povjerenstva: Antun Alegro (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Domagoj Đikić (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Petra Korać (član povjerenstva)
• Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj: Sveučilište u Zagrebu; Prirodoslovno-matematički fakultet; (Biološki odsjek); Zagreb
• Datum i država obrane: 2014-11-20, Hrvatska
• Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana: PRIRODNE ZNANOSTI; Biologija

Sažetak

DNA barkodiranje je novo predložena metoda molekularne taksonomije koja korištenjem kratkih univerzalnih sekvenci koje su dovoljno različite kod svih organizama od interesa omogućava brzu i preciznu identifikaciju biološkog materijala. U ovom radu sam istražio uspješnost DNA barkodiranja kao taksonomske metode za identifikaciju biljnih i životinjskih vrsta te barkodirao devet autohtonih hrvatskih biljnih vrsta i divokozu Rupicapra rupicapra L. (Bovidae) te na osnovi dobivenih barkodova rekonstruirao filogenetski odnos populacija divokoze iz Hrvatske. Na kraju sam se dotakao i problema s kojima se ova metoda suočava, najčešće u vidu malih razlika među barkodovima raziličitih vrsta, problematičnog barkodiranja biljaka zbog spore evolucije plastidnog genoma i izolacije biljnih gena i problema pri određivanju životinjskih vrsta zbog specifičnog načina evolucije životinjskog mitohondrijskog genoma te prijedloga za njezino poboljšanje.

Sažetak (engleski)

DNA barcoding is a newly proposed method of molecular taxonomy, which by the usage of short, universal sequences that are divergent enough in all organisms of interest, allows fast and precise identification of biological material. In this paper, I examined the fidelity of DNA barcoding as a taxonomic method for identification of plant and animal species. I also barcoded nine autochthonous Croatian plant species and chamois Rupicapra rupicapra L. (Bovidae), and conducted analysis of phylogenetic relations of chamois populations from Croatia based on collected barcode sequences. In the end, I considered the problems concerning the method, as well as suggestions for its improvement. Considered problems are mostly small differences between barcodes of different organisms, problematic barcoding of plants due to slow evolution of plastid genome and isolation of plant genes and problematic determination of animals due to specific evolution of animal mitochondrial genome.

• Ključne riječi: molekularna taksonomija; matK; rbcL; COI; divokoza
• Ključne riječi (engleski): molecular taxonomy; matK; rbcL; COI; chamois
• Jezik: hrvatski
• URN:NBN: urn:nbn:hr:217:832636
• Studijski program: Naziv: Eksperimentalna biologija; Vrsta studija: sveučilišni; Stupanj studija: diplomski; Akademski / stručni naziv: magistar/magistra eksperimentalne biologije (mag. biol. exp.)
• Vrsta resursa: Tekst
• Način izrade datoteke: Izvorno digitalna
• Prava pristupa: Pristup korisnicima matične ustanove
• Datum i vrijeme pohrane: 2017-04-26 08:52:03